RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	ELO3	P40319	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	PSF2	P40359	213 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	COA1	P40452	197 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	HIS6	P40545	261 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	FMP32	P43557	207 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	MRK1	P50873	501 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	NUP100	Q02629	959 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	RMI1	Q02685	241 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	TAF12	Q03761	539 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	DYN3	Q04949	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	GRX8	Q05926	109 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	LCB4	Q12246	624 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	MDY2	Q12285	212 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	NMT1	P14743	455 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	CLN1	P20437	546 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	CCA1	P21269	546 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	PHO3	P24031	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	FUB1	P25659	250 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	THI80	P35202	319 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ECM4	P36156	370 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	POA1	P38218	177 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	TDP1	P38319	544 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ARN1	P38731	627 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	OPT1	P40897	799 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	IRC5	P43610	853 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	GET1	P53192	235 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SLM2	P53955	656 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	CDC14	Q00684	551 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	GCN5	Q03330	439 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	HLR1	Q04429	423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	CIA1	Q05583	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SGT1	Q08446	395 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	NUS1	Q12063	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	UPC2	Q12151	913 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ATR1	P13090	542 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YCR099C	P25657	155 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ADK2	P26364	225 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
TRS33	YOR115C	RAD16	P31244	790 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	NGG1	P32494	702 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	CSE1	P33307	960 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	GCS1	P35197	352 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	EXO84	P38261	753 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	MUP3	P38734	546 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YHR078W	P38799	552 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ECM10	P39987	644 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	UBP7	P40453	1071 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SSY5	P47002	699 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	BOL2	P53082	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	PET117	Q02771	107 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	PIR3	Q03180	325 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	GOT1	Q03554	138 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	GAS3	Q03655	524 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ASM4	Q05166	528 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	RIF2	Q06208	395 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
TRS33	YOR115C	PGC1	Q08959	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	HUA2	Q12134	243 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YOR342C	Q12182	319 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SEM1	O94742	89 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SUC2	P00724	532 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ATP6	P00854	259 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SNF4	P12904	322 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	TYR1	P20049	452 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	RBK1	P25332	333 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	HXT4	P32467	576 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	PAH1	P32567	862 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YPT7	P32939	208 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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