RNA–Protein interactions for RNA: YNR042W

YNR042W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNR042W, Length 429 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR042W	YNR042W	PAC11	P40960	533 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	MNN5	P46982	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	TOM22	P49334	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	KAP114	P53067	1004 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PEX8	P53248	589 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	TAF12	Q03761	539 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	RNH1	Q04740	348 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PST1	Q12355	444 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	BPH1	P25356	2167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	CDC21	P06785	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PEX5	P35056	612 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	GGC1	P38988	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SEO1	P39709	593 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PKP1	P40530	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	AZF1	P41696	914 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	ROG1	P53118	685 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	UME1	Q03010	460 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SRN2	Q99176	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	MET2	P08465	486 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	RSR1	P13856	272 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YCL068C	P25593	260 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SEC65	P29478	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	ELM1	P32801	640 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	THI80	P35202	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	RRN3	P36070	627 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SMF2	P38778	549 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	BZZ1	P38822	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YIL169C	P40442	995 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	APQ12	P40532	138 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	CIN1	P40987	1014 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	MDV1	P47025	714 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	MDM34	P53083	459 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YGR067C	P53243	804 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YGR079W	P53249	370 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	DUG3	P53871	357 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	TFB2	Q02939	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	MIX14	Q04341	121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SOV1	Q04748	898 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	TMA16	Q08687	178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SFG1	Q12507	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	MTR10	Q99189	972 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	RAD10	P06838	210 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	PHO3	P24031	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	ATS1	P31386	333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	HIR2	P32480	875 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	CDC5	P32562	705 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	LOT5	P34234	306 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	BLI1	P35727	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	KKQ8	P36004	724 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	RRT2	P38332	387 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	MEP1	P40260	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	ERR3	P42222	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	PET130	P47065	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	STE24	P47154	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	YGR021W	P53212	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	ASI1	P54074	624 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	ERG5	P54781	538 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	NHX1	Q04121	633 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	OPY2	Q06810	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	NUS1	Q12063	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	RMD5	Q12508	421 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	PRB1	P09232	635 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	DAP2	P18962	818 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	YCK1	P23291	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	SMI1	P32566	505 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR042W	YNR042W	LRG1	P35688	1017 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44 ms