RNA–Protein interactions for RNA: YNL218W

MGS1, Transcript of Protein with DNA-dependent ATPase and ssDNA annealing activities, yeast

Gene MGS1, Length 1,764 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGS1	YNL218W	HXT15	P54854	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	SPR6	Q01684	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	RRN5	Q02983	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	ECM11	Q04110	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	AIM32	Q04689	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	MCD1	Q12158	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	RPN6	Q12377	434 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	ARP7	Q12406	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	CCP1	P00431	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	COX4	P04037	155 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	SWI5	P08153	709 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	ENA1	P13587	1091 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	VPS33	P20795	691 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	MSS51	P32335	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	YBR242W	P38331	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	YEL020C	P39994	560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	FKH2	P41813	862 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	PET130	P47065	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	GCV2	P49095	1034 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	SHY1	P53266	389 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
MGS1	YNL218W	SLG1	P54867	378 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	TAF12	Q03761	539 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	VTA1	Q06263	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	SWC7	Q06707	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	MFG1	Q07684	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	COS7	Q07788	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	THP1	Q08231	455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	TRE2	Q08693	809 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	DDC1	Q08949	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	NUS1	Q12063	375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	RTR2	Q12378	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	HMG1	P12683	1054 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	ACH1	P32316	526 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	PTM1	P32857	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	AIM26	P32858	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	CTF13	P35203	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	RIB1	P38066	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	GPX2	P38143	162 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	STB5	P38699	743 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	MTW1	P39731	289 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	KTR7	P40504	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	SNX4	P47057	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	MRX6	P48564	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	STB4	P50104	949 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	MET13	P53128	600 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
MGS1	YNL218W	RBD2	Q12270	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	AFI1	Q99222	893 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	SIR1	P21691	654 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	GPT2	P36148	743 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	PIM1	P36775	1133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	MSC7	P38694	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	OSH7	P38755	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	YHR045W	P38775	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	VAC8	P39968	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	RGI2	P40188	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	NTA1	P40354	457 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	SER2	P42941	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	CAF120	P53836	1060 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	IRC15	Q02733	499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	MUK1	Q02866	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	ARA2	Q04212	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MGS1	YNL218W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.4 ms