RNA–Protein interactions for RNA: YLR363C

NMD4, Transcript of Protein that may be involved in nonsense-mediated mRNA decay, yeast

Gene NMD4, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD4	YLR363C	ALY1	P36117	915 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	ATG27	P46989	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	ALT2	P52892	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	ARP5	P53946	755 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	SMA1	Q02651	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	AIM33	Q04516	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	SNO4	Q04902	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	HSP32	Q08992	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	CDC23	P16522	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	GID7	P25569	745 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	DRE2	P36152	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	SLX1	P38324	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	PHO90	P39535	881 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	RGI2	P40188	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	ESL1	P40456	1118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	YIL060W	P40519	144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	CLN3	P13365	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	GAA1	P39012	614 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	BUR6	P40096	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	FIS1	P40515	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	INN1	P53901	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	YML131W	Q03102	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	TIP41	Q12199	356 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	NKP1	Q12493	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	MYO1	P08964	1928 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	EPL1	P43572	832 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	AAD10	P47182	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	YGL260W	P53056	76 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	CUL3	P53202	744 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	CBK1	P53894	756 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	COQ9	Q05779	260 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	YLH47	Q06493	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	PSR1	Q07800	427 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	DPH2	P32461	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	TRS65	P32893	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	YHL026C	P38740	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	YJR061W	P40355	935 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	YIR014W	P40570	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	FET5	P43561	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	VID30	P53076	958 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	NUP100	Q02629	959 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	BSC1	Q12140	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	MOT1	P32333	1867 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	UBR2	Q07963	1872 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	BAR1	P12630	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	RER1	P25560	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	PGS1	P25578	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	DPB3	P27344	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	ARP1	P38696	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	LAM5	P43560	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	RTC4	P53850	401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	PNG1	Q02890	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	FUS2	Q05670	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	SDH5	Q08230	162 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	RDR1	Q08904	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	RPC53	P25441	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	ADK2	P26364	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	BYE1	P36106	594 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	SIP4	P46954	829 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	PKP2	P53170	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	ALG1	P16661	449 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	CKA2	P19454	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	MIC60	P36112	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	MRX3	P38172	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	UBA4	P38820	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	ANS1	P38832	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	YJL070C	P40361	888 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NMD4	YLR363C	DIA3	P52290	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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