RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	MUK1	Q02866	612 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	PHO92	Q06390	306 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	NDL1	Q06568	189 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	THP1	Q08231	455 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
RPS0B	YLR048W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	PMR1	P13586	950 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	YCR006C	P25350	157 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	BEM1	P29366	551 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	MRPL40	P36534	297 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	ARP1	P38696	384 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	YHR131C	P38835	850 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	VPS45	P38932	577 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	YER130C	P39959	443 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	SNG1	P46950	547 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	PRM1	P53835	661 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	GIS1	Q03833	894 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	SUT2	Q12286	268 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	BI2	P03873	423 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	GPA1	P08539	472 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	ATP10	P18496	279 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	MAK32	P23060	363 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	MSS51	P32335	436 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	RPC34	P32910	317 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	YHR210C	P38893	341 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	ERV46	P39727	415 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	YIP5	P53108	310 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	DUG3	P53871	357 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	KIN4	Q01919	800 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	YLH47	Q06493	454 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	ACF2	Q12168	779 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	CEX1	Q12453	761 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	STE3	P06783	470 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	KIN3	P22209	435 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	CNA1	P23287	553 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	RNQ1	P25367	405 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	RHB1	P25378	209 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	DMC1	P25453	334 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	RDS1	P25611	832 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	SIN4	P32259	974 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	VPS17	P32913	551 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	TRM2	P33753	639 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	BNA4	P38169	460 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	UBA4	P38820	440 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	ORC5	P50874	479 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	ALF1	P53904	254 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	GRX3	Q03835	250 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	VPS20	Q04272	221 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	MSC3	Q05812	728 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	PDR8	Q06149	701 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	POS5	Q06892	414 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	SRN2	Q99176	213 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0B	YLR048W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SNF3	P10870	884 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	ALG1	P16661	449 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	NUP1	P20676	1076 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	OCT1	P35999	772 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	PCA1	P38360	1216 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	VPS41	P38959	992 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	NMD5	P46970	1048 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	YJL043W	P47053	257 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	PIB2	P53191	635 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	ASI1	P54074	624 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS0B	YLR048W	MDM30	Q05930	598 aa		4.65	□□□□□ -1.67

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