RNA–Protein interactions for RNA: YJL013C

MAD3, Transcript of Subunit of spindle-assembly checkpoint complex, yeast

Gene MAD3, Length 1,548 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MAD3	YJL013C	SHR3	Q02774	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	PSY3	Q12318	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	MTR10	Q99189	972 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	DAP2	P18962	818 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	YTA12	P40341	825 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	IRC10	Q08118	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	PDE2	P06776	526 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	ATP10	P18496	279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	PFF1	P38244	976 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	VHS2	P40463	436 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	NAS2	P40555	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	IRC7	P43623	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	TOM22	P49334	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	ARP10	Q04549	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	RDR1	Q08904	546 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	RIP1	P08067	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	PEP5	P12868	1029 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	KRE2	P27809	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	BEM1	P29366	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	MSN2	P33748	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	MRPL4	P36517	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	SLI1	P53304	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	DUG2	P38149	878 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	LAG1	P38703	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	VPS41	P38959	992 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	HXT9	P40885	567 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	CHS6	P40955	746 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	POP1	P41812	875 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	TAX4	P47030	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	BUD32	P53323	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	OCA2	P53949	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	VTI1	Q04338	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	SPH1	Q06160	661 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	PFA4	Q12006	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	CNA1	P23287	553 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	RHB1	P25378	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	REC114	P32841	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	MLH1	P38920	769 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	YER130C	P39959	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	YIL089W	P40500	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	MCP2	Q06567	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	HER1	Q12276	1246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	PMR1	P13586	950 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	TYR1	P20049	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	SIN4	P32259	974 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	SPC110	P32380	944 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	HOT13	P36078	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	VRG4	P40107	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	PCL7	P40186	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	PKP2	P53170	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	SOL4	P53315	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	ATP23	P53722	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	SMA1	Q02651	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	YFH1	Q07540	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	UBX3	Q12229	455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	GEX1	P25596	615 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	ADY2	P25613	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	YJR154W	P47181	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	SHE4	P51534	789 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	YNR068C	P53754	272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	AQR1	P53943	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	MGR3	Q04472	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	PNS1	Q12412	539 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	RRI1	Q12468	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	EDE1	P34216	1381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	YPR089W	O13585	888 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	SNC1	P31109	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	ATP11	P32453	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MAD3	YJL013C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.4 ms