RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	YNL140C	P53910	189 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	SWS2	P53937	143 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	IRC15	Q02733	499 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	ATG26	Q06321	1198 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	YVC1	Q12324	675 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	TPK2	P06245	380 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	PPH21	P23594	369 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	MEI5	P32489	222 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	ATO2	P32907	282 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	MRPL37	P36532	105 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	YBR071W	P38243	211 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	GGC1	P38988	300 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	AYR1	P40471	297 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	MAM33	P40513	266 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	FMP32	P43557	207 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	TRM82	Q03774	444 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	JLP1	Q12358	412 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	ATP6	P00854	259 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	KAR1	P11927	433 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	TRX3	P25372	127 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	TFB1	P32776	642 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	EMC3	P36039	253 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	YAL037W	P39728	267 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	JEM1	P40358	645 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	IMA5	P40884	581 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	AZF1	P41696	914 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	GIP3	Q03016	1276 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	HSP31	Q04432	237 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	ATP7	P30902	174 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	HES1	P35843	434 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	MRPL17	P36528	281 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	PIM1	P36775	1133 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	CBP4	P37267	147 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	FTH1	P38310	465 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	ELO1	P39540	310 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	YMR010W	Q03687	405 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	HAL9	Q12180	1030 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	YLL054C	Q12244	843 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	ARG81	P05085	880 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	IST2	P38250	946 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	ATG7	P38862	630 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	CIS3	P47001	227 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	AIM22	P47051	409 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	ILM1	P47155	203 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	MMT1	Q03218	510 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	GGA1	Q06336	557 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	EAF1	Q06337	982 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	THI73	Q07904	523 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	NMD4	Q12129	218 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	YOR114W	Q12219	294 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	ARG3	P05150	338 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	ATP4	P05626	244 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	MRP13	P12686	339 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	CMP2	P14747	604 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	PRI2	P20457	528 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	KKQ8	P36004	724 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	COS111	P38308	924 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	SOL3	P38858	249 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	AXL2	P38928	823 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	DIA3	P52290	468 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	MFB1	Q04922	465 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	MUM3	Q08750	479 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	SIN4	P32259	974 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	SFC1	P33303	322 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	DOM34	P33309	386 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	ROT2	P38138	954 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	RRN10	P38204	145 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RNQ1	YCL028W	MET30	P39014	640 aa		10.75	□□□□□ -0.69

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