RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507771.5

ITGA3-210, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 399 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-210ENST00000507771 CNPY2Q9Y2B0 182 aa12.74□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa12.74□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 DTNBO60941 627 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 MMP1P03956 469 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 HMGCRP04035 888 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 GRK4P32298 578 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 UBXN2AP68543 259 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 KRT40Q6A162 431 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 TAAR1Q96RJ0 339 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 TINF2Q9BSI4 451 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 PXMP2Q9NR77 195 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 PCDHA6Q9UN73 950 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa12.73□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa12.72□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 SOWAHBA6NEL2 793 aa12.72□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 CCND2P30279 289 aa12.72□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 STXBP2Q15833 593 aa12.72□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa12.72□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 XRRA1Q6P2D8 792 aa12.72□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa12.72□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 KRT25Q7Z3Z0 450 aa12.72□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 NPLOC4Q8TAT6 608 aa12.72□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa12.72□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 SMCHD1A6NHR9 2005 aa12.71□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 STAM2O75886 525 aa12.71□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 ELNP15502 786 aa12.71□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 CLK2P49760 499 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 CAP1Q01518 475 aa12.71□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 GUCY1B3Q02153 619 aa12.71□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 ARMCX2Q7L311 632 aa12.71□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.71□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 ANO3Q9BYT9 981 aa12.71□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa12.71□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 COL20A1Q9P218 1284 aa12.71□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 NRBP1Q9UHY1 535 aa12.71□□□□□ -0.37
ITGA3-210ENST00000507771 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 NR3C2P08235 984 aa12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF76P36508 570 aa12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 PGM5Q15124 567 aa12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 CCL14Q16627 93 aa12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 GNPTABQ3T906 1256 aa12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 MCTP1Q6DN14 999 aa12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 NLRX1Q86UT6 975 aa12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 TRIB2Q92519 343 aa12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 PDCD2LQ9BRP1 358 aa12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 VTA1Q9NP79 307 aa12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 GJB4Q9NTQ9 266 aa12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 TMEM260Q9NX78 707 aa12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa12.7□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 FRMPD4Q14CM0 1322 aa12.69□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 INHAP05111 366 aa12.69□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 EDNRBP24530 442 aa12.69□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 CYP2C19P33261 490 aa12.69□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 SREBF1P36956 1147 aa12.69□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 PCNX4Q63HM2 1172 aa12.69□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 RASGRP4Q8TDF6 673 aa12.69□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 MORC4Q8TE76 937 aa12.69□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 FLRT1Q9NZU1 646 aa12.69□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 DOCK3Q8IZD9 2030 aa12.69□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 RPTORQ8N122 1335 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 BTBD18B2RXH4 712 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 CNGA1P29973 690 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 USP11P51784 963 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 ARHGAP4P98171 946 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 ACVR2BQ13705 512 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 KCNV1Q6PIU1 500 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 EEPD1Q7L9B9 569 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 VSIG10LQ86VR7 867 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 TBCKQ8TEA7 893 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 SH3TC2Q8TF17 1288 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 SHISA4Q96DD7 197 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 CDHR1Q96JP9 859 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 PGBD1Q96JS3 809 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 FGD4Q96M96 766 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 MCOLN1Q9GZU1 580 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 ASTN1O14525 1302 aa12.67□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 M0R2N6 131 aa12.67□□□□□ -0.38
ITGA3-210ENST00000507771 MAFGO15525 162 aa12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms