RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 FLRT1Q9NZU1 646 aa15.38■□□□□ 0.05
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PGGT1B-204ENST00000503638 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.38■□□□□ 0.05
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PGGT1B-204ENST00000503638 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.04
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PGGT1B-204ENST00000503638 SHISA4Q96DD7 197 aa15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 UNC93B1Q9H1C4 597 aa15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 PCDHA6Q9UN73 950 aa15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 PCDHA4Q9UN74 947 aa15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 ASTN1O14525 1302 aa15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 FOSP01100 380 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 NR3C2P08235 984 aa15.31■□□□□ 0.04
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