RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W TAF5P38129 798 aa13.37□□□□□ -0.27
YLR349WYLR349W LEU3P08638 886 aa13.36□□□□□ -0.27
YLR349WYLR349W PAF1P38351 445 aa13.36□□□□□ -0.27
YLR349WYLR349W UBP1P25037 809 aa13.35□□□□□ -0.27
YLR349WYLR349W YBL086CP38177 466 aa13.35□□□□□ -0.27
YLR349WYLR349W RPN11P43588 306 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
YLR349WYLR349W RTC1Q08281 1341 aa13.35□□□□□ -0.27
YLR349WYLR349W FKS3Q04952 1785 aa13.31□□□□□ -0.28
YLR349WYLR349W CPS1P27614 576 aa13.3□□□□□ -0.28
YLR349WYLR349W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
YLR349WYLR349W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
YLR349WYLR349W RCM1P53972 490 aa13.28□□□□□ -0.28
YLR349WYLR349W DOT5P40553 215 aa13.27□□□□□ -0.29
YLR349WYLR349W PSK1P31374 1356 aa13.26□□□□□ -0.29
YLR349WYLR349W SSA1P10591 642 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
YLR349WYLR349W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
YLR349WYLR349W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
YLR349WYLR349W PPH3P32345 308 aa13.21□□□□□ -0.29
YLR349WYLR349W UGA2P38067 497 aa13.21□□□□□ -0.29
YLR349WYLR349W NPR2P39923 615 aa13.21□□□□□ -0.29
YLR349WYLR349W TAF8Q03750 510 aa13.21□□□□□ -0.29
YLR349WYLR349W IES2P40154 320 aa13.2□□□□□ -0.3
YLR349WYLR349W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
YLR349WYLR349W NAP1P25293 417 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
YLR349WYLR349W SSA2P10592 639 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
YLR349WYLR349W YRF1-3P0CX14 1859 aa13.15□□□□□ -0.3
YLR349WYLR349W YRF1-7P0CX15 1859 aa13.15□□□□□ -0.3
YLR349WYLR349W YRF1-6P53819 1859 aa13.15□□□□□ -0.3
YLR349WYLR349W GTT3P39996 337 aa13.15□□□□□ -0.3
YLR349WYLR349W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
YLR349WYLR349W ROM2P51862 1356 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
YLR349WYLR349W EDE1P34216 1381 aa13.13□□□□□ -0.31
YLR349WYLR349W YJL181WP46987 611 aa13.13□□□□□ -0.31
YLR349WYLR349W ALD2P47771 506 aa13.12□□□□□ -0.31
YLR349WYLR349W CTH1P47976 325 aa13.12□□□□□ -0.31
YLR349WYLR349W NOP7P53261 605 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
YLR349WYLR349W RSF2P46974 1380 aa13.11□□□□□ -0.31
YLR349WYLR349W TCB1Q12466 1186 aa13.09□□□□□ -0.31
YLR349WYLR349W YIL177CP40434 1758 aa13.05□□□□□ -0.32
YLR349WYLR349W YJL225CP40889 1758 aa13.05□□□□□ -0.32
YLR349WYLR349W RRD1P40454 393 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
YLR349WYLR349W PRP40P33203 583 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
YLR349WYLR349W ESL2P36168 1195 aa13.04□□□□□ -0.32
YLR349WYLR349W LAM6Q08001 693 aa13.03□□□□□ -0.32
YLR349WYLR349W COBP00163 385 aa13.02□□□□□ -0.33
YLR349WYLR349W SLM3Q12093 417 aa13.02□□□□□ -0.33
YLR349WYLR349W YKL133CP36066 463 aa13□□□□□ -0.33
YLR349WYLR349W YRF1-4O13559 1382 aa12.99□□□□□ -0.33
YLR349WYLR349W YKR075CP36155 307 aa12.99□□□□□ -0.33
YLR349WYLR349W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
YLR349WYLR349W APC1P53886 1748 aa12.98□□□□□ -0.33
YLR349WYLR349W SNF2P22082 1703 aa12.94□□□□□ -0.34
YLR349WYLR349W CSE4P36012 229 aa12.94□□□□□ -0.34
YLR349WYLR349W ENP1P38333 483 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
YLR349WYLR349W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
YLR349WYLR349W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
YLR349WYLR349W XKS1P42826 600 aa12.93□□□□□ -0.34
YLR349WYLR349W SPE2P21182 396 aa12.89□□□□□ -0.35
YLR349WYLR349W RPG1P38249 964 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
YLR349WYLR349W PRP43P53131 767 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
YLR349WYLR349W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
YLR349WYLR349W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
YLR349WYLR349W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
YLR349WYLR349W KIP3P53086 805 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
YLR349WYLR349W RIM15P43565 1770 aa12.82□□□□□ -0.36
YLR349WYLR349W BDF1P35817 686 aa12.82□□□□□ -0.36
YLR349WYLR349W EAF6P47128 113 aa12.82□□□□□ -0.36
YLR349WYLR349W ALD3P54114 506 aa12.8□□□□□ -0.36
YLR349WYLR349W SPT7P35177 1332 aa12.8□□□□□ -0.36
YLR349WYLR349W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
YLR349WYLR349W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
YLR349WYLR349W ADE16P54113 591 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
YLR349WYLR349W YML133CQ03099 1374 aa12.74□□□□□ -0.37
YLR349WYLR349W YLL067CQ07888 1374 aa12.74□□□□□ -0.37
YLR349WYLR349W YLL066CQ99208 1374 aa12.74□□□□□ -0.37
YLR349WYLR349W TOM1Q03280 3268 aa12.73□□□□□ -0.37
YLR349WYLR349W MSB4Q12317 492 aa12.73□□□□□ -0.37
YLR349WYLR349W RCR1P38212 213 aa12.7□□□□□ -0.38
YLR349WYLR349W MEC3Q02574 474 aa12.7□□□□□ -0.38
YLR349WYLR349W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
YLR349WYLR349W DPS1P04802 557 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
YLR349WYLR349W BUG1Q12191 341 aa12.69□□□□□ -0.38
YLR349WYLR349W SIR4P11978 1358 aa12.69□□□□□ -0.38
YLR349WYLR349W GAS4Q08271 471 aa12.68□□□□□ -0.38
YLR349WYLR349W TOS1P38288 455 aa12.67□□□□□ -0.38
YLR349WYLR349W SAP155P43612 1002 aa12.67□□□□□ -0.38
YLR349WYLR349W MSN5P52918 1224 aa12.67□□□□□ -0.38
YLR349WYLR349W SSA4P22202 642 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
YLR349WYLR349W SQS1P53866 767 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
YLR349WYLR349W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
YLR349WYLR349W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
YLR349WYLR349W HPC2Q01448 625 aa12.62□□□□□ -0.39
YLR349WYLR349W ATG13Q06628 738 aa12.62□□□□□ -0.39
YLR349WYLR349W YER156CP40093 338 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
YLR349WYLR349W MHP1P43638 1398 aa12.6□□□□□ -0.39
YLR349WYLR349W KIN4Q01919 800 aa12.6□□□□□ -0.39
YLR349WYLR349W CTT1P06115 562 aa12.59□□□□□ -0.39
YLR349WYLR349W RAD4P14736 754 aa12.59□□□□□ -0.39
YLR349WYLR349W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
YLR349WYLR349W RIX7Q07844 837 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 71.2 ms