RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
SKG6	YHR149C	HAP1	P0CE41	1502 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SKG6	YHR149C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
SKG6	YHR149C	PAF1	P38351	445 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SKG6	YHR149C	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
SKG6	YHR149C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
SKG6	YHR149C	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
SKG6	YHR149C	REB1	P21538	810 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SKG6	YHR149C	PSH1	Q12161	406 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SKG6	YHR149C	LEU3	P08638	886 aa		5.29	□□□□□ -1.56
SKG6	YHR149C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
SKG6	YHR149C	SPC110	P32380	944 aa		5.29	□□□□□ -1.56
SKG6	YHR149C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
SKG6	YHR149C	SRB8	P25648	1427 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SKG6	YHR149C	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
SKG6	YHR149C	ROX1	P25042	368 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SKG6	YHR149C	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
SKG6	YHR149C	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
SKG6	YHR149C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	SSM4	P40318	1319 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	USO1	P25386	1790 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	YSP2	Q06681	1438 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	CTR9	P89105	1077 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	PLP2	Q12017	286 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	SMC3	P47037	1230 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	BNR1	P40450	1375 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	YAP3	P38749	330 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	RAD26	P40352	1085 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	UBP9	P39967	754 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	YIR014W	P40570	242 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	VMR1	P38735	1592 aa		5.21	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	IML1	P47170	1584 aa		5.21	□□□□□ -1.57
SKG6	YHR149C	YPP1	P46951	817 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	YNL011C	P53980	444 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	DJP1	P40564	432 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	SWE1	P32944	819 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	VPS4	P52917	437 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	MAK10	Q02197	733 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	DOS2	P54858	310 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	EDE1	P34216	1381 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	MSH3	P25336	1018 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	DSN1	P40568	576 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	NNF2	P53253	936 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SKG6	YHR149C	PCT1	P13259	424 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	CLB5	P30283	435 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	SIC1	P38634	284 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	TGL3	P40308	642 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	MSP1	P28737	362 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	LTV1	P34078	463 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	IFH1	P39520	1085 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	YMR196W	Q04336	1088 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	GRX3	Q03835	250 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	BYE1	P36106	594 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	TPM2	P40414	161 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	MHP1	P43638	1398 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.11	□□□□□ -1.59	not detected
SKG6	YHR149C	NST1	P53935	1240 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	IOC4	Q04213	475 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	CKB1	P43639	278 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	MED8	P38304	223 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	CLB1	P24868	471 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SKG6	YHR149C	RAD2	P07276	1031 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SKG6	YHR149C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SKG6	YHR149C	DEP1	P31385	405 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SKG6	YHR149C	TCD1	P38756	429 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SKG6	YHR149C	ECM1	P39715	212 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SKG6	YHR149C	VPS60	Q03390	229 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SKG6	YHR149C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SKG6	YHR149C	IPL1	P38991	367 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SKG6	YHR149C	CIN4	P39110	191 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SKG6	YHR149C	ESC2	Q06340	456 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SKG6	YHR149C	CDC45	Q08032	650 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SKG6	YHR149C	GCN2	P15442	1659 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SKG6	YHR149C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6

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