RNA–Protein interactions for RNA: YGR229C

SMI1, Transcript of Protein involved in the regulation of cell wall synthesis, yeast

Gene SMI1, Length 1,518 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMI1	YGR229C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SMI1	YGR229C	CLB5	P30283	435 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMI1	YGR229C	GEF1	P37020	779 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMI1	YGR229C	SAS4	Q04003	481 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMI1	YGR229C	ATG36	P46983	293 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMI1	YGR229C	MRX12	P47084	519 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMI1	YGR229C	ATF2	P53296	535 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMI1	YGR229C	SRC1	Q03707	834 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMI1	YGR229C	AIM7	Q12156	149 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMI1	YGR229C	GLC3	P32775	704 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SMI1	YGR229C	YPR109W	Q06104	294 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SMI1	YGR229C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SMI1	YGR229C	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SMI1	YGR229C	RAS1	P01119	309 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	YRR1	Q12172	810 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	AMS1	P22855	1083 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	TEA1	P47988	759 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	LAM6	Q08001	693 aa		5	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		5	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	MET10	P39692	1035 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	SWE1	P32944	819 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	BRN1	P38170	754 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	NUD1	P32336	851 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	NPL4	P33755	580 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SMI1	YGR229C	TRK1	P12685	1235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	FAR11	P53917	953 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	SDH2	P21801	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	SPC42	P36094	363 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	ERG12	P07277	443 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	STR2	P47164	639 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	RRN6	P32786	894 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	ISM1	P48526	1002 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	NIS1	P53939	407 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	SIT4	P20604	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	RTF1	P53064	558 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	TFB3	Q03290	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	YTA7	P40340	1379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	RTS3	P53289	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	FPK1	P53739	893 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	PKC1	P24583	1151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	SLD2	P34252	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	HST2	P53686	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	YNL115C	P53925	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMI1	YGR229C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	YJR008W	P47085	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	CSN12	P47130	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TPO2	P53283	614 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	KEX2	P13134	814 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	HPC2	Q01448	625 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	OCA5	P38738	679 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
SMI1	YGR229C	MDG1	P53885	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	MMP1	Q12372	583 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	DOS2	P54858	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	SLY41	P22215	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	HEM3	P28789	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	BIM1	P40013	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	SEC2	P17065	759 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	VPS72	Q03388	795 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	ERF2	Q06551	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	ATG32	P40458	529 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	SCJ1	P25303	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMI1	YGR229C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.3 ms