RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeastyeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT105YER104W TY1A-PR2P0CX60 440 aa6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W TY1A-DR5P0CX65 440 aa6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W TY1A-ER2P0CX66 440 aa6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W TY1A-GR3P0CX67 440 aa6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W TY1A-LR1P0CX68 440 aa6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W TY1A-MR2P0CX69 440 aa6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W SEC2P17065 759 aa6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W TY1A-JR2P47099 440 aa6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W TY1A-DR1Q03856 440 aa6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W TY1A-BRQ12217 440 aa6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W TY1A-NL2Q12470 440 aa6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W TY1A-GR2Q12485 440 aa6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W KIC1P38692 1080 aa6.74□□□□□ -1.33
RTT105YER104W PAT1P25644 796 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RTT105YER104W RRN7P40992 514 aa6.72□□□□□ -1.33
RTT105YER104W ASH1P34233 588 aa6.71□□□□□ -1.34
RTT105YER104W SET1P38827 1080 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RTT105YER104W YDR090CQ03193 310 aa6.7□□□□□ -1.34
RTT105YER104W AFT1P22149 690 aa6.68□□□□□ -1.34
RTT105YER104W HST3P53687 447 aa6.68□□□□□ -1.34
RTT105YER104W RRD1P40454 393 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RTT105YER104W IFH1P39520 1085 aa6.66□□□□□ -1.34
RTT105YER104W MET32Q12041 191 aa6.66□□□□□ -1.34
RTT105YER104W ORC6P38826 435 aa6.58□□□□□ -1.36
RTT105YER104W YJR115WP47152 169 aa6.58□□□□□ -1.36
RTT105YER104W CAF120P53836 1060 aa6.57□□□□□ -1.36
RTT105YER104W TRK2P28584 889 aa6.56□□□□□ -1.36
RTT105YER104W ACO2P39533 789 aa6.55□□□□□ -1.36
RTT105YER104W MVP1P40959 511 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RTT105YER104W MOD5P07884 428 aa6.53□□□□□ -1.36
RTT105YER104W YPR109WQ06104 294 aa6.51□□□□□ -1.37
RTT105YER104W PUS5Q06244 254 aa6.51□□□□□ -1.37
RTT105YER104W YGR035CP53222 116 aa6.5□□□□□ -1.37
RTT105YER104W KEX2P13134 814 aa6.49□□□□□ -1.37
RTT105YER104W PAC1P39946 494 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RTT105YER104W REF2P42073 533 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RTT105YER104W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RTT105YER104W ERF2Q06551 359 aa6.47□□□□□ -1.37
RTT105YER104W YLR346CQ06139 101 aa6.45□□□□□ -1.38
RTT105YER104W OPT2Q06593 877 aa6.45□□□□□ -1.38
RTT105YER104W RGR1P19263 1082 aa6.44□□□□□ -1.38
RTT105YER104W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RTT105YER104W HPF1Q05164 967 aa6.42□□□□□ -1.38
RTT105YER104W AGE1Q04412 482 aa6.4□□□□□ -1.38
RTT105YER104W TUB4P53378 473 aa6.39□□□□□ -1.39
RTT105YER104W SRF1Q12516 437 aa6.39□□□□□ -1.39
RTT105YER104W UGA3P26370 528 aa6.38□□□□□ -1.39
RTT105YER104W ICP55P40051 511 aa6.38□□□□□ -1.39
RTT105YER104W YIR007WP40566 764 aa6.38□□□□□ -1.39
RTT105YER104W PTK2P47116 818 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RTT105YER104W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RTT105YER104W COX6P00427 148 aa6.37□□□□□ -1.39
RTT105YER104W GLY1P37303 387 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RTT105YER104W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RTT105YER104W LSB3P43603 459 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RTT105YER104W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RTT105YER104W YPR204WQ08995 1032 aa6.35□□□□□ -1.39
RTT105YER104W SCW11P53189 542 aa6.34□□□□□ -1.39
RTT105YER104W YPR148CQ06523 435 aa6.32□□□□□ -1.4
RTT105YER104W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RTT105YER104W TPD3P31383 635 aa6.31□□□□□ -1.4
RTT105YER104W NUP85P46673 744 aa6.31□□□□□ -1.4
RTT105YER104W KXD1P53158 218 aa6.31□□□□□ -1.4
RTT105YER104W MIP1P15801 1254 aa6.3□□□□□ -1.4
RTT105YER104W TY1A-BLQ12266 440 aa6.3□□□□□ -1.4
RTT105YER104W RTF1P53064 558 aa6.29□□□□□ -1.4
RTT105YER104W HXT10P43581 546 aa6.27□□□□□ -1.41
RTT105YER104W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data6.27□□□□□ -1.41not detected
RTT105YER104W PHM7Q12252 991 aa6.25□□□□□ -1.41
RTT105YER104W YNL115CP53925 644 aa6.24□□□□□ -1.41
RTT105YER104W CLB5P30283 435 aa6.23□□□□□ -1.41
RTT105YER104W RTT106P40161 455 aa6.23□□□□□ -1.41
RTT105YER104W DPH6Q12429 685 aa6.23□□□□□ -1.41
RTT105YER104W VPS70P47161 811 aa6.22□□□□□ -1.41
RTT105YER104W KIP2P28743 706 aa6.2□□□□□ -1.42
RTT105YER104W UBP2Q01476 1272 aa6.2□□□□□ -1.42
RTT105YER104W PDC1P06169 563 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RTT105YER104W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RTT105YER104W MRT4P33201 236 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RTT105YER104W LSC2P53312 427 aa6.17□□□□□ -1.42
RTT105YER104W IXR1P33417 597 aa6.15□□□□□ -1.42
RTT105YER104W MDJ1P35191 511 aa6.15□□□□□ -1.42
RTT105YER104W SIT4P20604 311 aa6.14□□□□□ -1.43
RTT105YER104W ROG3P43602 733 aa6.14□□□□□ -1.43
RTT105YER104W ARG82P07250 355 aa6.13□□□□□ -1.43
RTT105YER104W LYS5P50113 272 aa6.12□□□□□ -1.43
RTT105YER104W AAD14P42884 376 aa6.11□□□□□ -1.43
RTT105YER104W TY1A-MR1Q04215 440 aa6.11□□□□□ -1.43
RTT105YER104W NSG2P53898 299 aa6.1□□□□□ -1.43
RTT105YER104W ALR1Q08269 859 aa6.1□□□□□ -1.43
RTT105YER104W JJJ3P47138 172 aa6.08□□□□□ -1.44
RTT105YER104W YJR098CP47139 656 aa6.08□□□□□ -1.44
RTT105YER104W TCB1Q12466 1186 aa6.08□□□□□ -1.44
RTT105YER104W OSH7P38755 437 aa6.07□□□□□ -1.44
RTT105YER104W CCT8P47079 568 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RTT105YER104W RPA14P50106 137 aa6.07□□□□□ -1.44
RTT105YER104W CCP1P00431 361 aa6.06□□□□□ -1.44
RTT105YER104W YPR097WQ06839 1073 aa6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.1 ms