RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W BNR1P40450 1375 aa15.72■□□□□ 0.11
SSA4YER103W VMR1P38735 1592 aa15.72■□□□□ 0.11
SSA4YER103W TRK1P12685 1235 aa15.71■□□□□ 0.11
SSA4YER103W SPE2P21182 396 aa15.71■□□□□ 0.11
SSA4YER103W MPP10P47083 593 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
SSA4YER103W SIS2P36024 562 aa15.69■□□□□ 0.1
SSA4YER103W VPS24P36095 224 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SSA4YER103W YRF1-1P0CX20 1796 aa15.68■□□□□ 0.1
SSA4YER103W YRF1-5P0CX21 1796 aa15.68■□□□□ 0.1
SSA4YER103W YRF1-8P0CX22 1796 aa15.68■□□□□ 0.1
SSA4YER103W IML1P47170 1584 aa15.66■□□□□ 0.1
SSA4YER103W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
SSA4YER103W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
SSA4YER103W EDE1P34216 1381 aa15.66■□□□□ 0.1
SSA4YER103W RAD2P07276 1031 aa15.65■□□□□ 0.1
SSA4YER103W MSP1P28737 362 aa15.65■□□□□ 0.1
SSA4YER103W HAP1P0CE41 1502 aa15.62■□□□□ 0.09
SSA4YER103W FKH1P40466 484 aa15.6■□□□□ 0.09
SSA4YER103W NOT3P06102 836 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SSA4YER103W ARL1P38116 183 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SSA4YER103W CTR9P89105 1077 aa15.56■□□□□ 0.08
SSA4YER103W TRM3Q07527 1436 aa15.56■□□□□ 0.08
SSA4YER103W SAP155P43612 1002 aa15.56■□□□□ 0.08
SSA4YER103W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SSA4YER103W QCR6P00127 147 aa15.55■□□□□ 0.08
SSA4YER103W DAL5P15365 543 aa15.55■□□□□ 0.08
SSA4YER103W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SSA4YER103W YIL092WP40497 633 aa15.55■□□□□ 0.08
SSA4YER103W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SSA4YER103W POL32P47110 350 aa15.54■□□□□ 0.08
SSA4YER103W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SSA4YER103W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data15.53■□□□□ 0.08not detected
SSA4YER103W YAP3P38749 330 aa15.52■□□□□ 0.07
SSA4YER103W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SSA4YER103W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SSA4YER103W RLF2Q12495 606 aa15.5■□□□□ 0.07
SSA4YER103W AIM44Q99299 758 aa15.49■□□□□ 0.07
SSA4YER103W TEA1P47988 759 aa15.47■□□□□ 0.07
SSA4YER103W KRE5P22023 1365 aa15.47■□□□□ 0.07
SSA4YER103W TPD3P31383 635 aa15.46■□□□□ 0.07
SSA4YER103W YPP1P46951 817 aa15.46■□□□□ 0.07
SSA4YER103W TAF8Q03750 510 aa15.46■□□□□ 0.07
SSA4YER103W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SSA4YER103W MET5P47169 1442 aa15.42■□□□□ 0.06
SSA4YER103W THI22Q06490 572 aa15.41■□□□□ 0.06
SSA4YER103W ITC1P53125 1264 aa15.41■□□□□ 0.06
SSA4YER103W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
SSA4YER103W DNF3Q12674 1656 aa15.39■□□□□ 0.05
SSA4YER103W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SSA4YER103W YML133CQ03099 1374 aa15.38■□□□□ 0.05
SSA4YER103W YLL067CQ07888 1374 aa15.38■□□□□ 0.05
SSA4YER103W YLL066CQ99208 1374 aa15.38■□□□□ 0.05
SSA4YER103W PRD1P25375 712 aa15.37■□□□□ 0.05
SSA4YER103W BCK1Q01389 1478 aa15.36■□□□□ 0.05
SSA4YER103W SIR4P11978 1358 aa15.35■□□□□ 0.05
SSA4YER103W YRF1-4O13559 1382 aa15.35■□□□□ 0.05
SSA4YER103W NAP1P25293 417 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
SSA4YER103W CSE4P36012 229 aa15.34■□□□□ 0.05
SSA4YER103W RAD9P14737 1309 aa15.33■□□□□ 0.05
SSA4YER103W SRS2P12954 1174 aa15.33■□□□□ 0.04
SSA4YER103W MTC1P47018 478 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
SSA4YER103W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
SSA4YER103W ALD4P46367 519 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
SSA4YER103W HAP5Q02516 242 aa15.31■□□□□ 0.04
SSA4YER103W KAR2P16474 682 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
SSA4YER103W YGR130CP53278 816 aa15.3■□□□□ 0.04
SSA4YER103W LCD1Q04377 747 aa15.3■□□□□ 0.04
SSA4YER103W COG8Q04632 607 aa15.3■□□□□ 0.04
SSA4YER103W RTT109Q07794 436 aa15.29■□□□□ 0.04
SSA4YER103W RSC1P53236 928 aa15.28■□□□□ 0.04
SSA4YER103W PIL1P53252 339 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SSA4YER103W PAP2P53632 584 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SSA4YER103W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SSA4YER103W NUP145P49687 1317 aa15.22■□□□□ 0.03
SSA4YER103W TRP5P00931 707 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
SSA4YER103W RKM3P38222 552 aa15.21■□□□□ 0.02
SSA4YER103W ROM2P51862 1356 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SSA4YER103W TYS1P36421 394 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SSA4YER103W RRT14P40470 206 aa15.19■□□□□ 0.02
SSA4YER103W MDG1P53885 366 aa15.19■□□□□ 0.02
SSA4YER103W DLD1P32891 587 aa15.18■□□□□ 0.02
SSA4YER103W RAD50P12753 1312 aa15.18■□□□□ 0.02
SSA4YER103W TPM2P40414 161 aa15.17■□□□□ 0.02
SSA4YER103W CAB1Q04430 367 aa15.17■□□□□ 0.02
SSA4YER103W ESC2Q06340 456 aa15.17■□□□□ 0.02
SSA4YER103W MCM2P29469 868 aa15.16■□□□□ 0.02
SSA4YER103W HIM1Q06674 414 aa15.16■□□□□ 0.02
SSA4YER103W TAP42Q04372 366 aa15.15■□□□□ 0.02
SSA4YER103W NKP2Q06162 153 aa15.15■□□□□ 0.02
SSA4YER103W ILV3P39522 585 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SSA4YER103W BDH2P39713 417 aa15.15■□□□□ 0.02
SSA4YER103W CIR1P42940 261 aa15.14■□□□□ 0.01
SSA4YER103W PSK1P31374 1356 aa15.14■□□□□ 0.01
SSA4YER103W RPN1P38764 993 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SSA4YER103W NPA3P47122 385 aa15.13■□□□□ 0.01
SSA4YER103W GCR2Q01722 534 aa15.13■□□□□ 0.01
SSA4YER103W RPN12P32496 274 aa15.11■□□□□ 0.01
SSA4YER103W AVT3P36062 692 aa15.11■□□□□ 0.01
SSA4YER103W RVS167P39743 482 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SSA4YER103W IPL1P38991 367 aa15.1■□□□□ 0.01
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