RNA–Protein interactions for RNA: YBR049C

REB1, Transcript of RNA polymerase I enhancer binding protein, yeast

Gene REB1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REB1	YBR049C	AIM44	Q99299	758 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REB1	YBR049C	YEL023C	P39992	682 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	PEX21	P50091	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	CDC73	Q06697	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	PUP1	P25043	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	MRX12	P47084	519 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	RSC30	P38781	883 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	MRX10	Q05648	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	LAM6	Q08001	693 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	PTC4	P38089	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	SLY41	P22215	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	RIM21	P48565	533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	YML083C	Q04526	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	YPP1	P46951	817 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	RTF1	P53064	558 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	TGL4	P36165	910 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	YNL115C	P53925	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	HAT1	Q12341	374 aa		4.9	□□□□□ -1.62
REB1	YBR049C	HEM3	P28789	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
REB1	YBR049C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	JIP4	Q03361	876 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	DPL1	Q05567	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	YRR1	Q12172	810 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	PEP12	P32854	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	PUS6	P53294	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	WSC3	Q12215	556 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	MPC54	Q08550	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	ISU2	Q12056	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	MCM16	Q12262	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	ECM23	Q02710	187 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	RRN6	P32786	894 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
REB1	YBR049C	MID1	P41821	548 aa		4.84	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	TBF1	Q02457	562 aa		4.84	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	KEX2	P13134	814 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	KTR7	P40504	517 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	GAL2	P13181	574 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	PML39	Q03760	334 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	ENV9	Q08651	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	NUD1	P32336	851 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	MET10	P39692	1035 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	SEC20	P28791	383 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	ASF1	P32447	279 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	UBX7	P38349	436 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	ERF2	Q06551	359 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	NPL4	P33755	580 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	EMP47	P43555	445 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	ULI1	P43604	169 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	NMA111	P53920	997 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	ISF1	P32488	338 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	PEX29	Q03370	554 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	IPL1	P38991	367 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	ATG3	P40344	310 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	YDL206W	Q12424	762 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	TOP1	P04786	769 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	ERP5	P38819	212 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	VNX1	P42839	908 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	KAR5	Q04746	504 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	ITT1	Q04638	464 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
REB1	YBR049C	TEC1	P18412	486 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REB1	YBR049C	GUT2	P32191	649 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REB1	YBR049C	RPA14	P50106	137 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REB1	YBR049C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
REB1	YBR049C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
REB1	YBR049C	FRA1	Q07825	749 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REB1	YBR049C	PHO87	P25360	923 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REB1	YBR049C	IOC2	Q12072	812 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REB1	YBR049C	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REB1	YBR049C	HAP4	P14064	554 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REB1	YBR049C	ISM1	P48526	1002 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REB1	YBR049C	TUB4	P53378	473 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REB1	YBR049C	AGE1	Q04412	482 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REB1	YBR049C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
REB1	YBR049C	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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