RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
GLIS1-202ENST00000628545 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.44■■□□□ 1.34
GLIS1-202ENST00000628545 MAP3K1Q13233 1512 aa23.44■■□□□ 1.34
GLIS1-202ENST00000628545 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.44■■□□□ 1.34
GLIS1-202ENST00000628545 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
GLIS1-202ENST00000628545 RRP9O43818 475 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GLIS1-202ENST00000628545 IGF1RP08069 1367 aa23.39■■□□□ 1.34
GLIS1-202ENST00000628545 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
GLIS1-202ENST00000628545 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
GLIS1-202ENST00000628545 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.38■■□□□ 1.33
GLIS1-202ENST00000628545 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.36■■□□□ 1.33
GLIS1-202ENST00000628545 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GLIS1-202ENST00000628545 MS4A1P11836 297 aa23.35■■□□□ 1.33
GLIS1-202ENST00000628545 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.35■■□□□ 1.33
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC7Q96M83 1385 aa23.34■■□□□ 1.33
GLIS1-202ENST00000628545 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GLIS1-202ENST00000628545 IFT140Q96RY7 1462 aa23.33■■□□□ 1.32
GLIS1-202ENST00000628545 UACAQ9BZF9 1416 aa23.32■■□□□ 1.32
GLIS1-202ENST00000628545 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.31■■□□□ 1.32
GLIS1-202ENST00000628545 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.31■■□□□ 1.32
GLIS1-202ENST00000628545 SLC4A3P48751 1232 aa23.3■■□□□ 1.32
GLIS1-202ENST00000628545 NCOA1Q15788 1441 aa23.3■■□□□ 1.32
GLIS1-202ENST00000628545 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.29■■□□□ 1.32
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GLIS1-202ENST00000628545 AAMPQ13685 434 aa23.29■■□□□ 1.32
GLIS1-202ENST00000628545 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GLIS1-202ENST00000628545 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
GLIS1-202ENST00000628545 FGD1P98174 961 aa23.26■■□□□ 1.31
GLIS1-202ENST00000628545 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.26■■□□□ 1.31
GLIS1-202ENST00000628545 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GLIS1-202ENST00000628545 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GLIS1-202ENST00000628545 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
GLIS1-202ENST00000628545 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
GLIS1-202ENST00000628545 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.21■■□□□ 1.31
GLIS1-202ENST00000628545 PBRM1Q86U86 1689 aa23.2■■□□□ 1.3
GLIS1-202ENST00000628545 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
GLIS1-202ENST00000628545 CUL7Q14999 1698 aa23.2■■□□□ 1.3
GLIS1-202ENST00000628545 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
GLIS1-202ENST00000628545 HFM1A2PYH4 1435 aa23.18■■□□□ 1.3
GLIS1-202ENST00000628545 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.18■■□□□ 1.3
GLIS1-202ENST00000628545 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.16■■□□□ 1.3
GLIS1-202ENST00000628545 SKAP1Q86WV1 359 aa23.15■■□□□ 1.3
GLIS1-202ENST00000628545 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
GLIS1-202ENST00000628545 PDE4CQ08493 712 aa23.14■■□□□ 1.29
GLIS1-202ENST00000628545 GRIN2BQ13224 1484 aa23.13■■□□□ 1.29
GLIS1-202ENST00000628545 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
GLIS1-202ENST00000628545 PTPRKQ15262 1439 aa23.11■■□□□ 1.29
GLIS1-202ENST00000628545 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
GLIS1-202ENST00000628545 NAIPQ13075 1403 aa23.08■■□□□ 1.29
GLIS1-202ENST00000628545 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.08■■□□□ 1.29
GLIS1-202ENST00000628545 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.08■■□□□ 1.28
GLIS1-202ENST00000628545 ADAMTS12P58397 1594 aa23.07■■□□□ 1.28
GLIS1-202ENST00000628545 PRDM4Q9UKN5 801 aa23.06■■□□□ 1.28
GLIS1-202ENST00000628545 FMN1Q68DA7 1419 aa23.05■■□□□ 1.28
GLIS1-202ENST00000628545 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
GLIS1-202ENST00000628545 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.05■■□□□ 1.28
GLIS1-202ENST00000628545 CLCN1P35523 988 aa23.05■■□□□ 1.28
GLIS1-202ENST00000628545 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
GLIS1-202ENST00000628545 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.04■■□□□ 1.28
GLIS1-202ENST00000628545 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
GLIS1-202ENST00000628545 POGKQ9P215 609 aa23.02■■□□□ 1.28
GLIS1-202ENST00000628545 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
GLIS1-202ENST00000628545 P3H3Q8IVL6 736 aa23■■□□□ 1.27
GLIS1-202ENST00000628545 TMC1Q8TDI8 760 aa22.99■■□□□ 1.27
GLIS1-202ENST00000628545 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
GLIS1-202ENST00000628545 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
GLIS1-202ENST00000628545 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.97■■□□□ 1.27
GLIS1-202ENST00000628545 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.97■■□□□ 1.27
GLIS1-202ENST00000628545 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
GLIS1-202ENST00000628545 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
GLIS1-202ENST00000628545 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.95■■□□□ 1.26
GLIS1-202ENST00000628545 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.94■■□□□ 1.26
GLIS1-202ENST00000628545 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.94■■□□□ 1.26
GLIS1-202ENST00000628545 RGS3P49796 1198 aa22.93■■□□□ 1.26
GLIS1-202ENST00000628545 PLIN1O60240 522 aa22.92■■□□□ 1.26
GLIS1-202ENST00000628545 FAM161AQ3B820 660 aa22.91■■□□□ 1.26
GLIS1-202ENST00000628545 CRBNQ96SW2 442 aa22.9■■□□□ 1.26
GLIS1-202ENST00000628545 HECW1Q76N89 1606 aa22.9■■□□□ 1.26
GLIS1-202ENST00000628545 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
GLIS1-202ENST00000628545 C8orf34Q49A92 452 aa22.9■■□□□ 1.26
GLIS1-202ENST00000628545 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.9■■□□□ 1.26
GLIS1-202ENST00000628545 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
GLIS1-202ENST00000628545 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
GLIS1-202ENST00000628545 SYNJ2O15056 1496 aa22.88■■□□□ 1.25
GLIS1-202ENST00000628545 GRIN2AQ12879 1464 aa22.88■■□□□ 1.25
GLIS1-202ENST00000628545 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.87■■□□□ 1.25
GLIS1-202ENST00000628545 ARXQ96QS3 562 aa22.87■■□□□ 1.25
GLIS1-202ENST00000628545 FOXD1Q16676 465 aa22.86■■□□□ 1.25
GLIS1-202ENST00000628545 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.86■■□□□ 1.25
GLIS1-202ENST00000628545 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
GLIS1-202ENST00000628545 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.83■■□□□ 1.24
GLIS1-202ENST00000628545 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.82■■□□□ 1.24
GLIS1-202ENST00000628545 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.82■■□□□ 1.24
GLIS1-202ENST00000628545 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
GLIS1-202ENST00000628545 FBLN2P98095 1184 aa22.81■■□□□ 1.24
GLIS1-202ENST00000628545 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
GLIS1-202ENST00000628545 PDE3BQ13370 1112 aa22.81■■□□□ 1.24
GLIS1-202ENST00000628545 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.8■■□□□ 1.24
GLIS1-202ENST00000628545 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93 ms