RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ARHGEF5Q12774 1597 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PTPRKQ15262 1439 aa9.57□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 CROCC2H7BZ55 1655 aa9.56□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCER2I3L3R5 266 aa9.56□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TSPY4P0CV99 314 aa9.56□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TSPY10P0CW01 314 aa9.56□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NCOA1Q15788 1441 aa9.56□□□□□ -0.88
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 MIER1Q8N108 512 aa9.54□□□□□ -0.88
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.51□□□□□ -0.89
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 ERBINQ96RT1 1412 aa9.41□□□□□ -0.9
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.4□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.4□□□□□ -0.9
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IQGAP3Q86VI3 1631 aa9.36□□□□□ -0.91
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.35□□□□□ -0.91
SOX9-AS1-208ENST00000529667 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.35□□□□□ -0.91
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LAMC1P11047 1609 aa9.35□□□□□ -0.91
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CFAP74Q9C0B2 1584 aa9.35□□□□□ -0.91
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MAGI2Q86UL8 1455 aa9.34□□□□□ -0.91
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.34□□□□□ -0.91
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM135AQ9P2D6 1515 aa9.34□□□□□ -0.91
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ABCA9Q8IUA7 1624 aa9.33□□□□□ -0.92
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCDC7Q96M83 1385 aa9.33□□□□□ -0.92
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCDC144AA2RUR9 1427 aa9.32□□□□□ -0.92
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ABCC1P33527 1531 aa9.32□□□□□ -0.92
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ARID3CA6NKF2 412 aa9.32□□□□□ -0.92
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TTC37Q6PGP7 1564 aa9.32□□□□□ -0.92
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
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