RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.51■■□□□ 1.51
PACS1-205ENST00000527224 PLIN1O60240 522 aa24.5■■□□□ 1.51
PACS1-205ENST00000527224 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.49■■□□□ 1.51
PACS1-205ENST00000527224 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PACS1-205ENST00000527224 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.48■■□□□ 1.51
PACS1-205ENST00000527224 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.46■■□□□ 1.51
PACS1-205ENST00000527224 RRP9O43818 475 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PACS1-205ENST00000527224 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.515e-7■■■■■ 37.5
PACS1-205ENST00000527224 KIF27Q86VH2 1401 aa24.45■■□□□ 1.5
PACS1-205ENST00000527224 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.44■■□□□ 1.5
PACS1-205ENST00000527224 NCOA1Q15788 1441 aa24.43■■□□□ 1.5
PACS1-205ENST00000527224 UACAQ9BZF9 1416 aa24.4■■□□□ 1.5
PACS1-205ENST00000527224 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.39■■□□□ 1.5
PACS1-205ENST00000527224 FOXD1Q16676 465 aa24.39■■□□□ 1.49
PACS1-205ENST00000527224 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.38■■□□□ 1.49
PACS1-205ENST00000527224 TMC1Q8TDI8 760 aa24.38■■□□□ 1.49
PACS1-205ENST00000527224 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.35■■□□□ 1.49
PACS1-205ENST00000527224 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PACS1-205ENST00000527224 PANK2Q9BZ23 570 aa24.35■■□□□ 1.49
PACS1-205ENST00000527224 CRBNQ96SW2 442 aa24.34■■□□□ 1.49
PACS1-205ENST00000527224 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PACS1-205ENST00000527224 PTPRKQ15262 1439 aa24.32■■□□□ 1.48
PACS1-205ENST00000527224 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PACS1-205ENST00000527224 MAP3K1Q13233 1512 aa24.32■■□□□ 1.48
PACS1-205ENST00000527224 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.31■■□□□ 1.48
PACS1-205ENST00000527224 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.3■■□□□ 1.48
PACS1-205ENST00000527224 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PACS1-205ENST00000527224 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.29■■□□□ 1.48
PACS1-205ENST00000527224 RGS3P49796 1198 aa24.29■■□□□ 1.48
PACS1-205ENST00000527224 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.27■■□□□ 1.48
PACS1-205ENST00000527224 C8orf34Q49A92 452 aa24.27■■□□□ 1.48
PACS1-205ENST00000527224 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.47
PACS1-205ENST00000527224 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.47
PACS1-205ENST00000527224 CLCN1P35523 988 aa24.26■■□□□ 1.47
PACS1-205ENST00000527224 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PACS1-205ENST00000527224 IGF1RP08069 1367 aa24.24■■□□□ 1.47
PACS1-205ENST00000527224 FAM161AQ3B820 660 aa24.24■■□□□ 1.47
PACS1-205ENST00000527224 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.24■■□□□ 1.47
PACS1-205ENST00000527224 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.23■■□□□ 1.47
PACS1-205ENST00000527224 HFM1A2PYH4 1435 aa24.21■■□□□ 1.47
PACS1-205ENST00000527224 NESP48681 1621 aa24.2■■□□□ 1.47
PACS1-205ENST00000527224 NAIPQ13075 1403 aa24.19■■□□□ 1.46
PACS1-205ENST00000527224 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.19■■□□□ 1.46
PACS1-205ENST00000527224 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.18■■□□□ 1.46
PACS1-205ENST00000527224 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.17■■□□□ 1.46
PACS1-205ENST00000527224 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.17■■□□□ 1.46
PACS1-205ENST00000527224 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PACS1-205ENST00000527224 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.16■■□□□ 1.46
PACS1-205ENST00000527224 SLC24A1O60721 1099 aa24.15■■□□□ 1.46
PACS1-205ENST00000527224 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.15■■□□□ 1.46
PACS1-205ENST00000527224 AAMPQ13685 434 aa24.14■■□□□ 1.45
PACS1-205ENST00000527224 FMN1Q68DA7 1419 aa24.13■■□□□ 1.45
PACS1-205ENST00000527224 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.13■■□□□ 1.45
PACS1-205ENST00000527224 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.12■■□□□ 1.45
PACS1-205ENST00000527224 ERBB4Q15303 1308 aa24.12■■□□□ 1.45
PACS1-205ENST00000527224 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PACS1-205ENST00000527224 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PACS1-205ENST00000527224 ARID3AQ99856 593 aa24.09■■□□□ 1.45
PACS1-205ENST00000527224 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PACS1-205ENST00000527224 PRDM4Q9UKN5 801 aa24.08■■□□□ 1.45
PACS1-205ENST00000527224 PRDM2Q13029 1718 aa24.08■■□□□ 1.44
PACS1-205ENST00000527224 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.07■■□□□ 1.44
PACS1-205ENST00000527224 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.06■■□□□ 1.44
PACS1-205ENST00000527224 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.05■■□□□ 1.44
PACS1-205ENST00000527224 ESPNB1AK53 854 aa24.04■■□□□ 1.44
PACS1-205ENST00000527224 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.04■■□□□ 1.44
PACS1-205ENST00000527224 SEC24BO95487 1268 aa24.04■■□□□ 1.44
PACS1-205ENST00000527224 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
PACS1-205ENST00000527224 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.03■■□□□ 1.44
PACS1-205ENST00000527224 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PACS1-205ENST00000527224 FGD1P98174 961 aa24.02■■□□□ 1.44
PACS1-205ENST00000527224 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PACS1-205ENST00000527224 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24■■□□□ 1.43
PACS1-205ENST00000527224 FSD2A1L4K1 749 aa24■■□□□ 1.43
PACS1-205ENST00000527224 USP19O94966 1318 aa23.98■■□□□ 1.43
PACS1-205ENST00000527224 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PACS1-205ENST00000527224 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.97■■□□□ 1.43
PACS1-205ENST00000527224 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.97■■□□□ 1.43
PACS1-205ENST00000527224 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.95■■□□□ 1.43
PACS1-205ENST00000527224 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.95■■□□□ 1.42
PACS1-205ENST00000527224 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PACS1-205ENST00000527224 TOPBP1Q92547 1522 aa23.94■■□□□ 1.42
PACS1-205ENST00000527224 BECN1Q14457 450 aa23.94■■□□□ 1.42
PACS1-205ENST00000527224 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PACS1-205ENST00000527224 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PACS1-205ENST00000527224 PDE3BQ13370 1112 aa23.92■■□□□ 1.42
PACS1-205ENST00000527224 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PACS1-205ENST00000527224 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.92■■□□□ 1.42
PACS1-205ENST00000527224 USP47Q96K76 1375 aa23.92■■□□□ 1.42
PACS1-205ENST00000527224 TPM2P07951 284 aa23.9■■□□□ 1.42
PACS1-205ENST00000527224 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PACS1-205ENST00000527224 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.89■■□□□ 1.42
PACS1-205ENST00000527224 KDM6BO15054 1643 aa23.89■■□□□ 1.41
PACS1-205ENST00000527224 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.89■■□□□ 1.41
PACS1-205ENST00000527224 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.89■■□□□ 1.41
PACS1-205ENST00000527224 MCM4P33991 863 aa23.88■■□□□ 1.41
PACS1-205ENST00000527224 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PACS1-205ENST00000527224 MRE11P49959 708 aa23.88■■□□□ 1.41
PACS1-205ENST00000527224 PDE4CQ08493 712 aa23.88■■□□□ 1.41
PACS1-205ENST00000527224 TRAK2O60296 914 aa23.87■■□□□ 1.41
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