RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARAP3Q8WWN8 1544 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-548P-201ENST00000517083 PKD2Q13563 968 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTPRGP23470 1445 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-548P-201ENST00000517083 CPS1P31327 1500 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR97A6NE52 1622 aa4.09□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 PREX1Q8TCU6 1659 aa4.09□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 FANCAO15360 1455 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM161AQ3B820 660 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 TTC37Q6PGP7 1564 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC125Q86Z20 511 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 WWC3Q9ULE0 1092 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 NHSL1Q5SYE7 1610 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSPA6P17066 643 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 SHANK2Q9UPX8 1470 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 DEFB132Q7Z7B7 95 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNH8Q96L42 1107 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNS2Q63HR2 1409 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 AKNAQ7Z591 1439 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 JCADQ9P266 1359 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 BCL9LQ86UU0 1499 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR7Q9Y4E6 1490 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 PHLDB1Q86UU1 1377 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 FGD5Q6ZNL6 1462 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 FHAD1B1AJZ9 1412 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM135BQ49AJ0 1406 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRP6O75581 1613 aa4.03□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 AFF2P51816 1311 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 NGLY1Q96IV0 654 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF39Q9H2S5 420 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 UACAQ9BZF9 1416 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLA2R1Q13018 1463 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNIKQ9UKE5 1360 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 NINLQ9Y2I6 1382 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 KDM5BQ9UGL1 1544 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 AATKQ6ZMQ8 1374 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADAMTS12P58397 1594 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 DLL1O00548 723 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 NWD1Q149M9 1564 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-548P-201ENST00000517083 APLP1P51693 650 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 FHOD3Q2V2M9 1422 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 C8orf37Q96NL8 207 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 NEO1Q92859 1461 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM83GA6ND36 823 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 JMYQ8N9B5 988 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 PBRM1Q86U86 1689 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 VWDEQ8N2E2 1590 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 CUL7Q14999 1698 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 BAG6P46379 1132 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPON1Q9HCB6 807 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 NPATQ14207 1427 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 FGD6Q6ZV73 1430 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP19O94966 1318 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADRA2BP18089 450 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 C9orf84Q5VXU9 1444 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 KLRG1Q96E93 195 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 EFCAB5A4FU69 1503 aa3.9□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa3.9□□□□□ -1.78
RNU6-548P-201ENST00000517083 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-548P-201ENST00000517083 EP400Q96L91 3159 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAGI2Q86UL8 1455 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRDM2Q13029 1718 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKLE2Q86XL3 938 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP10AO60312 1499 aa3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms