RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403848.2

RPL5P20-201, Transcript of ribosomal protein L5 pseudogene 20, humanhuman

BASIC

Gene RPL5P20, Length 896 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL5P20-201ENST00000403848 TOPBP1Q92547 1522 aa11.27□□□□□ -0.61
RPL5P20-201ENST00000403848 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
RPL5P20-201ENST00000403848 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.27□□□□□ -0.61
RPL5P20-201ENST00000403848 ST18O60284 1047 aa11.26□□□□□ -0.61
RPL5P20-201ENST00000403848 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
RPL5P20-201ENST00000403848 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.2□□□□□ -0.62
RPL5P20-201ENST00000403848 OCEL1Q9H607 264 aa11.2□□□□□ -0.62
RPL5P20-201ENST00000403848 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RPL5P20-201ENST00000403848 WDR97A6NE52 1622 aa11.17□□□□□ -0.62
RPL5P20-201ENST00000403848 GSE1Q14687 1217 aa11.17□□□□□ -0.62
RPL5P20-201ENST00000403848 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RPL5P20-201ENST00000403848 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RPL5P20-201ENST00000403848 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.12□□□□□ -0.63
RPL5P20-201ENST00000403848 SPOCK2Q92563 424 aa11.11□□□□□ -0.63
RPL5P20-201ENST00000403848 IFT140Q96RY7 1462 aa11.11□□□□□ -0.63
RPL5P20-201ENST00000403848 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.1□□□□□ -0.63
RPL5P20-201ENST00000403848 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
RPL5P20-201ENST00000403848 MARVELD3Q96A59 401 aa11.09□□□□□ -0.63
RPL5P20-201ENST00000403848 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.09□□□□□ -0.63
RPL5P20-201ENST00000403848 SOGA1O94964 1423 aa11.09□□□□□ -0.63
RPL5P20-201ENST00000403848 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
RPL5P20-201ENST00000403848 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
RPL5P20-201ENST00000403848 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
RPL5P20-201ENST00000403848 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
RPL5P20-201ENST00000403848 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
RPL5P20-201ENST00000403848 PSEN1P49768 467 aa11.05□□□□□ -0.64
RPL5P20-201ENST00000403848 PBRM1Q86U86 1689 aa11.04□□□□□ -0.64
RPL5P20-201ENST00000403848 SNPHO15079 494 aa11.03□□□□□ -0.64
RPL5P20-201ENST00000403848 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
RPL5P20-201ENST00000403848 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa11.03□□□□□ -0.64
RPL5P20-201ENST00000403848 GOLGA2Q08379 1002 aa11.02□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 KIF27Q86VH2 1401 aa11.01□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 SPNS2Q8IVW8 549 aa11□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 GAPVD1Q14C86 1478 aa11□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 MMRN1Q13201 1228 aa10.99□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 C3orf67Q6ZVT6 689 aa10.99□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 EEA1Q15075 1411 aa10.99□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 ERICH3Q5RHP9 1530 aa10.98□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.97□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 ADAMTS12P58397 1594 aa10.96□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 GRIN2BQ13224 1484 aa10.96□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 CABP2Q9NPB3 220 aa10.96□□□□□ -0.65
RPL5P20-201ENST00000403848 CUL7Q14999 1698 aa10.95□□□□□ -0.66
RPL5P20-201ENST00000403848 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.93□□□□□ -0.66
RPL5P20-201ENST00000403848 POTEB3A0JP26 581 aa10.93□□□□□ -0.66
RPL5P20-201ENST00000403848 POTEBQ6S5H4 581 aa10.93□□□□□ -0.66
RPL5P20-201ENST00000403848 IGF1RP08069 1367 aa10.92□□□□□ -0.66
RPL5P20-201ENST00000403848 EMP3P54852 163 aa10.92□□□□□ -0.66
RPL5P20-201ENST00000403848 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
RPL5P20-201ENST00000403848 KIF21BO75037 1637 aa10.91□□□□□ -0.66
RPL5P20-201ENST00000403848 PRXQ9BXM0 1461 aa10.91□□□□□ -0.66
RPL5P20-201ENST00000403848 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
RPL5P20-201ENST00000403848 CHD1O14646 1710 aa10.89□□□□□ -0.67
RPL5P20-201ENST00000403848 FAM205CA6NFA0 338 aa10.88□□□□□ -0.67
RPL5P20-201ENST00000403848 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10.88□□□□□ -0.67
RPL5P20-201ENST00000403848 HS3ST6Q96QI5 342 aa10.87□□□□□ -0.67
RPL5P20-201ENST00000403848 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa10.87□□□□□ -0.67
RPL5P20-201ENST00000403848 SYNJ2O15056 1496 aa10.87□□□□□ -0.67
RPL5P20-201ENST00000403848 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa10.86□□□□□ -0.67
RPL5P20-201ENST00000403848 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10.85□□□□□ -0.67
RPL5P20-201ENST00000403848 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.85□□□□□ -0.67
RPL5P20-201ENST00000403848 EFCAB3Q8N7B9 438 aa10.84□□□□□ -0.67
RPL5P20-201ENST00000403848 GRIN2AQ12879 1464 aa10.84□□□□□ -0.67
RPL5P20-201ENST00000403848 GOLGA3Q08378 1498 aa10.83□□□□□ -0.68
RPL5P20-201ENST00000403848 SOCS7O14512 581 aa10.82□□□□□ -0.68
RPL5P20-201ENST00000403848 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
RPL5P20-201ENST00000403848 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10.82□□□□□ -0.68
RPL5P20-201ENST00000403848 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa10.82□□□□□ -0.68
RPL5P20-201ENST00000403848 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
RPL5P20-201ENST00000403848 CEP170Q5SW79 1584 aa10.8□□□□□ -0.68
RPL5P20-201ENST00000403848 NUP160Q12769 1436 aa10.79□□□□□ -0.68
RPL5P20-201ENST00000403848 G3V3G9 751 aa10.78□□□□□ -0.68
RPL5P20-201ENST00000403848 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RPL5P20-201ENST00000403848 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RPL5P20-201ENST00000403848 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
RPL5P20-201ENST00000403848 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
RPL5P20-201ENST00000403848 LMTK3Q96Q04 1460 aa10.74□□□□□ -0.69
RPL5P20-201ENST00000403848 CLASP1Q7Z460 1538 aa10.74□□□□□ -0.69
RPL5P20-201ENST00000403848 IQGAP2Q13576 1575 aa10.74□□□□□ -0.69
RPL5P20-201ENST00000403848 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa10.72□□□□□ -0.69
RPL5P20-201ENST00000403848 TNIKQ9UKE5 1360 aa10.72□□□□□ -0.69
RPL5P20-201ENST00000403848 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa10.72□□□□□ -0.69
RPL5P20-201ENST00000403848 SHROOM2Q13796 1616 aa10.71□□□□□ -0.69
RPL5P20-201ENST00000403848 ZNF710Q8N1W2 664 aa10.71□□□□□ -0.69
RPL5P20-201ENST00000403848 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RPL5P20-201ENST00000403848 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.69□□□□□ -0.7
RPL5P20-201ENST00000403848 UGGT2Q9NYU1 1516 aa10.68□□□□□ -0.7
RPL5P20-201ENST00000403848 ERBB3P21860 1342 aa10.68□□□□□ -0.7
RPL5P20-201ENST00000403848 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
RPL5P20-201ENST00000403848 UBTFP17480 764 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RPL5P20-201ENST00000403848 SAMD9Q5K651 1589 aa10.68□□□□□ -0.7
RPL5P20-201ENST00000403848 TMEM92Q6UXU6 159 aa10.67□□□□□ -0.7
RPL5P20-201ENST00000403848 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.67□□□□□ -0.7
RPL5P20-201ENST00000403848 CEP162Q5TB80 1403 aa10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms