RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TOP2BQ02880 1626 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TOPBP1Q92547 1522 aa10.09□□□□□ -0.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.09□□□□□ -0.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CREBZFQ9NS37 354 aa10.08□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.08□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.08□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.07□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NECTIN2Q92692 538 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PYGBP11216 843 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RASEFQ8IZ41 740 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AKT1S1Q96B36 256 aa10.04□□□□□ -0.8
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM212AQ96EL1 285 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIF27Q86VH2 1401 aa10.02□□□□□ -0.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BARGINQ6ZT62 677 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 E2F4Q16254 413 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KDM4CQ9H3R0 1056 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 APBB1O00213 710 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EEA1Q15075 1411 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRR29P0C7W0 189 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYT1Q01538 1121 aa9.98□□□□□ -0.81
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 PITPNM1O00562 1244 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP1R37O75864 691 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MFRPQ9BY79 579 aa9.96□□□□□ -0.81
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.94□□□□□ -0.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AK7Q96M32 723 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.93□□□□□ -0.82
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 IFT140Q96RY7 1462 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM117AQ9C073 453 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GOLGA3Q08378 1498 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.9□□□□□ -0.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHADLQ6NUI6 762 aa9.9□□□□□ -0.83
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.88□□□□□ -0.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHD1O14646 1710 aa9.88□□□□□ -0.83
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 GRIN2BQ13224 1484 aa9.85□□□□□ -0.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.85□□□□□ -0.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TNIKQ9UKE5 1360 aa9.84□□□□□ -0.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.83□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR97A6NE52 1622 aa9.83□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIF21BO75037 1637 aa9.83□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.83□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CEP162Q5TB80 1403 aa9.82□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.82□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ERICH3Q5RHP9 1530 aa9.81□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.81□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PBRM1Q86U86 1689 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLIP1P30622 1438 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CUL7Q14999 1698 aa9.77□□□□□ -0.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARHGEF11O15085 1522 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADAMTS12P58397 1594 aa9.73□□□□□ -0.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.73□□□□□ -0.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRAK2O60296 914 aa9.73□□□□□ -0.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
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