RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109441.1

Ptprt-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprt, Length 6,623 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ccdc18Q640L5 1455 aa20.64■□□□□ 0.9
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Vps53Q8CCB4 832 aa20.63■□□□□ 0.89
Ptprt-201ENSMUST00000109441 NudcO35685 332 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Znf330Q922H9 316 aa20.62■□□□□ 0.89
Ptprt-201ENSMUST00000109441 MsnP26041 577 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Calcoco2A2A6M5 331 aa20.6■□□□□ 0.89
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Stk26Q99JT2 416 aa20.59■□□□□ 0.89
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Gm973E9Q295 1059 aa20.58■□□□□ 0.88
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Sox12Q04890 314 aa20.58■□□□□ 0.88
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Tmco5bQ80X59 307 aa20.57■□□□□ 0.88
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ppm1fQ8CGA0 452 aa20.57■□□□□ 0.88
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Bcl11aQ9QYE3 773 aa20.52■□□□□ 0.88
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ercc6F8VPZ5 1481 aa20.49■□□□□ 0.87
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Pibf1E9Q6K3 756 aa20.49■□□□□ 0.87
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa20.48■□□□□ 0.87
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Rwdd1Q9CQK7 243 aa20.48■□□□□ 0.87
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Q3TQI7 289 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Kdm5dQ62240 1548 aa20.41■□□□□ 0.86
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Tomm22Q9CPQ3 142 aa20.41■□□□□ 0.86
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Drc7Q6V3W6 876 aa20.37■□□□□ 0.85
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Tpd52l1O54818 204 aa20.37■□□□□ 0.85
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Ptprt-201ENSMUST00000109441 RdxP26043 583 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Chmp5Q9D7S9 219 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Dnai1Q8C0M8 701 aa20.34■□□□□ 0.85
Ptprt-201ENSMUST00000109441 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Ptprt-201ENSMUST00000109441 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa20.34■□□□□ 0.85
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa20.33■□□□□ 0.85
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Ptprt-201ENSMUST00000109441 R3hcc1Q8BSI6 488 aa20.32■□□□□ 0.84
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Pkd2O35245 966 aa20.31■□□□□ 0.84
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Trim30aP15533 496 aa20.31■□□□□ 0.84
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Chrna2Q91X60 512 aa20.31■□□□□ 0.84
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ccer1Q9CQL2 403 aa20.31■□□□□ 0.84
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Rundc1Q0VDN7 615 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Wdr78E9PYY5 807 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Exoc6Q8R313 802 aa20.28■□□□□ 0.84
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Psme1P97371 249 aa20.27■□□□□ 0.84
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Znf704Q9ERQ3 566 aa20.27■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Fmn1Q05860 1466 aa20.26■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Kif27Q7M6Z4 1394 aa20.25■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa20.25■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ciz1Q8VEH2 845 aa20.25■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa20.25■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 EspnQ9ET47 871 aa20.24■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Zfp777B9EKF4 885 aa20.23■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Map4P27546 1125 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 AcrbpQ3V140 540 aa20.23■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Krt82Q99M74 516 aa20.23■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 A0A0U1RNP2 1173 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Becn1O88597 448 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Fhad1A6PWD2 1420 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ripply1Q2WG77 201 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Pak3Q61036 559 aa20.21■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Dcaf11Q91VU6 549 aa20.2■□□□□ 0.82
Ptprt-201ENSMUST00000109441 CrbnQ8C7D2 445 aa20.2■□□□□ 0.82
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