RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109441.1

Ptprt-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprt, Length 6,623 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Rhox8Q6VSS7 320 aa28.65■■■□□ 2.18
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Wdr66E9Q743 1299 aa25.98■■□□□ 1.75
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ube2uB1AUC4 352 aa25.87■■□□□ 1.73
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa25.84■■□□□ 1.73
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Cngb1E1AZ71 1325 aa25.83■■□□□ 1.73
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Zeb1Q64318 1117 aa25.53■■□□□ 1.68
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa25.18■■□□□ 1.62
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Npm2Q80W85 207 aa24.92■■□□□ 1.58
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Myt1lP97500 1187 aa24.87■■□□□ 1.57
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Slc24a1Q91WD8 1130 aa24.85■■□□□ 1.57
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa24.66■■□□□ 1.54
Ptprt-201ENSMUST00000109441 CenpbP27790 599 aa24.44■■□□□ 1.5
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Trim41Q5NCC3 630 aa24.27■■□□□ 1.48
Ptprt-201ENSMUST00000109441 4933416C03RikQ3V063 378 aa24.14■■□□□ 1.46
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Neurod1Q60867 357 aa23.92■■□□□ 1.42
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Stra8P70278 393 aa23.91■■□□□ 1.42
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa23.82■■□□□ 1.4
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Il27Q8K3I6 234 aa23.71■■□□□ 1.39
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa23.66■■□□□ 1.38
Ptprt-201ENSMUST00000109441 NrdcQ8BHG1 1161 aa23.61■■□□□ 1.37
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ccdc180J3QNE4 1664 aa23.55■■□□□ 1.36
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
Ptprt-201ENSMUST00000109441 NclP09405 707 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Chic1Q8CBW7 227 aa23.4■■□□□ 1.34
Ptprt-201ENSMUST00000109441 HrcG5E8J6 738 aa23.36■■□□□ 1.33
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa23.33■■□□□ 1.33
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Rtl1Q7M732 1744 aa23.27■■□□□ 1.32
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Myt1Q8CFC2 1127 aa23.21■■□□□ 1.31
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Pcgf6Q99NA9 353 aa23.17■■□□□ 1.3
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Zbtb4Q5F293 982 aa23.1■■□□□ 1.29
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Tnnt3Q9QZ47 272 aa23.05■■□□□ 1.28
Ptprt-201ENSMUST00000109441 ArxO35085 564 aa23.05■■□□□ 1.28
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa23.04■■□□□ 1.28
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Gm13697A2AK42 830 aa22.97■■□□□ 1.27
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptprt-201ENSMUST00000109441 DaxxO35613 739 aa22.93■■□□□ 1.26
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Polr3glQ8R0C0 218 aa22.9■■□□□ 1.26
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Atp1b4Q99ME6 356 aa22.84■■□□□ 1.25
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Plppr3Q7TPB0 716 aa22.78■■□□□ 1.24
Ptprt-201ENSMUST00000109441 TonslQ6NZL6 1363 aa22.75■■□□□ 1.23
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Erich6D3Z6S9 713 aa22.73■■□□□ 1.23
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa22.72■■□□□ 1.23
Ptprt-201ENSMUST00000109441 CatipB9EKE5 520 aa22.69■■□□□ 1.22
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Gm38655A0A286YDK6 273 aa22.67■■□□□ 1.22
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Nlrp6Q91WS2 869 aa22.66■■□□□ 1.22
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Lmod2Q3UHZ5 550 aa22.65■■□□□ 1.22
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Csrnp3P59055 597 aa22.61■■□□□ 1.21
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Abcc9P70170 1546 aa22.59■■□□□ 1.21
Ptprt-201ENSMUST00000109441 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Lmod3E9QA62 571 aa22.53■■□□□ 1.2
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Gm13695A2AK44 830 aa22.53■■□□□ 1.2
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Mier1Q5UAK0 511 aa22.52■■□□□ 1.19
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Rtl5Q5DTT4 599 aa22.48■■□□□ 1.19
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Vsig10D3YX43 558 aa22.37■■□□□ 1.17
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa22.36■■□□□ 1.17
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa22.35■■□□□ 1.17
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Anp32aO35381 247 aa22.34■■□□□ 1.17
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Ptprt-201ENSMUST00000109441 ClspnQ80YR7 1315 aa22.2■■□□□ 1.14
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
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Ptprt-201ENSMUST00000109441 Eid3Q3V124 375 aa22.12■■□□□ 1.13
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Irx6Q9ER75 438 aa22.04■■□□□ 1.12
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Abcc8B2RUS7 1588 aa22.02■■□□□ 1.12
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa21.99■■□□□ 1.11
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Trim26Q99PN3 545 aa21.99■■□□□ 1.11
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Dcaf1Q80TR8 1506 aa21.87■■□□□ 1.09
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Sall2Q9QX96 1004 aa21.85■■□□□ 1.09
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Fgd1P52734 960 aa21.85■■□□□ 1.09
Ptprt-201ENSMUST00000109441 P3h3Q8CG70 732 aa21.8■■□□□ 1.08
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Cep164Q5DU05 1446 aa21.78■■□□□ 1.08
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Znf326O88291 580 aa21.77■■□□□ 1.08
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Anks4bQ8K3X6 423 aa21.77■■□□□ 1.08
Ptprt-201ENSMUST00000109441 Clstn1Q9EPL2 979 aa21.77■■□□□ 1.08
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