RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W GTO1P48239 356 aa10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RIM21P48565 533 aa10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W BRE5P53741 515 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W SMA1Q02651 245 aa10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W GOT1Q03554 138 aa10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data10.11□□□□□ -0.79not detected
PRP4YPR178W YOR022CQ12204 715 aa10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data10.11□□□□□ -0.79not detected
PRP4YPR178W PST2Q12335 198 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RPN6Q12377 434 aa10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W AFI1Q99222 893 aa10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W DBF2P22204 572 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W GPX2P38143 162 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W FET5P43561 622 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W MET12P46151 657 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W NUP85P46673 744 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W DLD2P46681 530 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W SCS3P53012 380 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W ROM1P53046 1155 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W DAM1P53267 343 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W NUP100Q02629 959 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W ECM11Q04110 302 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W YDR124WQ04608 324 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RCO1Q04779 684 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W HRD3Q05787 833 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W YHC1Q05900 231 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W PGC1Q08959 321 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W GLE1Q12315 538 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W FRT1Q99332 602 aa10.1□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RPL24BP24000 155 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W CHA1P25379 360 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RTG2P32608 588 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RPC34P32910 317 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W SCD5P34758 872 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W SLX8P40072 274 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W PTR3P43606 678 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W SNG1P46950 547 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W YJR098CP47139 656 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W DIE2P50076 525 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W TIM13P53299 105 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W CPR8P53728 308 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W YNL018CP53976 612 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W VTA1Q06263 330 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W YPS7Q06325 596 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W MCP2Q06567 569 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W MFG1Q07684 458 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W LDB18Q07887 179 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W BAG7Q12128 409 aa10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W TIM9O74700 87 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W HXK2P04807 486 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W CLN1P20437 546 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W CLN2P20438 545 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W AFT1P22149 690 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YCR099CP25657 155 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W MUM2P38236 366 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W SRP72P38688 640 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YHL041WP38730 149 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YHR045WP38775 560 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YAP1801P38856 637 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W ERV46P39727 415 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W SER3P40054 469 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W OPT1P40897 799 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W GPI8P49018 411 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W MET13P53128 600 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W STP1Q00947 519 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W MRPL13Q02204 264 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W RRN5Q02983 363 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W DBP9Q06218 594 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W THP1Q08231 455 aa10.08□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W CAP2P13517 287 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W POX1P13711 748 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W GRR1P24814 1151 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W OCA4P25366 362 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W RHB1P25378 209 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W GUT2P32191 649 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W ARP1P38696 384 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W ATG7P38862 630 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YHR219WP38900 624 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W GAB1P41733 394 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W PET130P47065 347 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W STR3P53101 465 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W SHY1P53266 389 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W MRPL50P53724 139 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YMR010WQ03687 405 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YLL007CQ07799 665 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W RBD2Q12270 262 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W ICT1Q12385 394 aa10.07□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W PRC1P00729 532 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W AMD1P15274 810 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.5 ms