RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A ATG26Q06321 1198 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A SEC63P14906 663 aa0.34□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A NAM9P27929 486 aa0.34□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A MF(ALPHA)2P32435 120 aa0.34□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A TFB1P32776 642 aa0.34□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YCR041WP37265 110 aa0.34□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A HXT6P39003 570 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A HXT7P39004 570 aa0.34□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A ERP2P39704 215 aa0.34□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YDL186WP48568 277 aa0.34□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A OCA1P50946 238 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A HOT1Q03213 719 aa0.34□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A EAF3Q12432 401 aa0.34□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A RPL15AP05748 204 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A CLN3P13365 580 aa0.34□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A CDC23P16522 626 aa0.34□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A FRE2P36033 711 aa0.34□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PIM1P36775 1133 aa0.34□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data0.34□□□□□ -2.36not detected
YPL060C-AYPL060C-A UBX4P54730 416 aa0.34□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A MDM1Q01846 1127 aa0.34□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A THP3Q12049 470 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A AYT1Q12226 474 aa0.34□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YOL114CQ12322 202 aa0.34□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YCL021W-AQ96VH3 125 aa0.34□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A LTE1P07866 1435 aa0.34□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A KGD2P19262 463 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A ERG3P32353 365 aa0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A STB6P36085 766 aa0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A IME4P41833 600 aa0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A ERG26P53199 349 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A HER2Q03557 464 aa0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YDR114CQ04597 100 aa0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PET111P08468 800 aa0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SLY1P22213 666 aa0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A LRE1P25579 583 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SAC6P32599 642 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A MRP21P38175 177 aa0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A CNM67P53865 581 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A RLI1Q03195 608 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A AIM32Q04689 311 aa0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SKG3Q06315 1026 aa0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A CAT8P39113 1433 aa0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A STR3P53101 465 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A NUP116Q02630 1113 aa0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A MRX8Q05473 314 aa0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A APM4Q99186 491 aa0.33□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A TY2A-LR1P0C2J4 438 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A TY2A-FP0CX61 438 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A TY2A-GR2P0CX62 438 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A TY2A-CP25383 438 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YCR100CP25606 316 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A BNA4P38169 460 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PCP1P53259 346 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A ZPR1P53303 486 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SLG1P54867 378 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A TY2A-DR2Q03483 438 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YMR155WQ03795 547 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A HNT3Q08702 217 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A TY2A-BQ12260 438 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A TY2A-OR2Q12293 438 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A TY2A-DR1Q12392 438 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A TY2A-OR1Q12439 438 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A TY2A-DR3Q99303 438 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PEP5P12868 1029 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A ATR1P13090 542 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A ADH7P25377 361 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A OXA1P39952 402 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SEC24P40482 926 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A IDP2P41939 412 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data0.32□□□□□ -2.36not detected
YPL060C-AYPL060C-A FAR3P46671 204 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A TIS11P47977 285 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YDL183CP48569 320 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PHB2P50085 310 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A MAL11P53048 616 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YGL262WP53054 175 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A MSO1P53604 210 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A HST1P53685 503 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A TRM112P53738 135 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A GTB1Q04924 702 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A CDC25P04821 1589 aa0.32□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A HEM2P05373 342 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PIF1P07271 859 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A RER1P25560 188 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SEC1P30619 724 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A IMA5P40884 581 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A IRC5P43610 853 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A ALK1P43633 760 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A URB2P47108 1174 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A IMD4P50094 524 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A MNP1P53163 194 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A IOC4Q04213 475 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YDL009CQ12210 107 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A RKM5Q12367 367 aa0.31□□□□□ -2.36
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