RNA–Protein interactions for RNA: YOR156C

NFI1, Transcript of SUMO E3 ligase, yeast

Gene NFI1, Length 2,181 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NFI1	YOR156C	BET4	Q00618	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YML122C	Q03207	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	DIC1	Q06143	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	BSC1	Q12140	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	SPC97	P38863	823 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YER130C	P39959	443 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YIL152W	P40455	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YIR016W	P40572	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	VTA1	Q06263	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	MLH2	Q07980	695 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	SUC2	P00724	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YPT53	P36019	220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	BNA4	P38169	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	HOM3	P10869	527 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	MGR1	P25573	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	MSN2	P33748	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	GCS1	P35197	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	DUG2	P38149	878 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YGL108C	P53139	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	RSC1	P53236	928 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	SMA1	Q02651	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	RSF1	Q05043	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	ARP6	Q12509	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YCR051W	P25631	222 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	STB6	P36085	766 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	SSU1	P41930	458 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	GUF1	P46943	645 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	RAV1	P47104	1357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	BAR1	P12630	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	TYR1	P20049	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	DBF4	P32325	704 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	YJL068C	P40363	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	ALT2	P52892	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	ROY1	Q04847	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	THI20	Q08224	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	DSE3	Q08729	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	RRD2	Q12461	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	RML2	P32611	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	YML6	P51998	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	CLC1	P17891	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	PPH22	P23595	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	ATO2	P32907	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	TUL1	P36096	758 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	RMT2	Q03305	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	SOV1	Q04748	898 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	APE1	P14904	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	YIM1	P28625	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	UTR4	P32626	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	HCS1	P34243	683 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	SAM50	P53969	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	MSS11	Q03825	758 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	RAD14	P28519	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	ACH1	P32316	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	AFG1	P32317	509 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	SYG1	P40528	902 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	YGR149W	P48236	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	FMP45	Q07651	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	RGT2	Q12300	763 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	BNA5	Q05979	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	HNM1	P19807	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	CLB1	P24868	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	ATP11	P32453	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	RAD24	P32641	659 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	CSM2	P40465	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	SLD5	Q03406	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	GLO2	Q05584	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	PHO92	Q06390	306 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.8 ms