RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A GWT1P47026 490 aa2.39□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A YGR126WP53274 230 aa2.39□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A EFM6P53970 246 aa2.39□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A PHO92Q06390 306 aa2.39□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A ETT1Q08421 412 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A YOR365CQ08844 703 aa2.39□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A YCR007CP25354 239 aa2.38□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A MAL33P38157 468 aa2.38□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A ARK1P53974 638 aa2.38□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A PIR3Q03180 325 aa2.38□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A TCO89Q08921 799 aa2.38□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A YDL012CQ12489 107 aa2.38□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A SUC2P00724 532 aa2.37□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A HHF1P02309 103 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A HIP1P06775 603 aa2.37□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A HEM15P16622 393 aa2.37□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A UTR4P32626 227 aa2.37□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A PRS1P32895 427 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A PSY4P38193 441 aa2.37□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A YHR210CP38893 341 aa2.37□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A YFL067WP43537 175 aa2.37□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A GTR1Q00582 310 aa2.37□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A LSP1Q12230 341 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A RBD2Q12270 262 aa2.37□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A SSM4P40318 1319 aa2.37□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A PEP4P07267 405 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A ARD1P07347 238 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A SLC1P33333 303 aa2.36□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A UBP11P36026 717 aa2.36□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A YGR127WP53275 312 aa2.36□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A RAD30Q04049 632 aa2.36□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A CPR4P25334 318 aa2.35□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A YBR144CP34215 104 aa2.35□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A ELP2P42935 788 aa2.35□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A FAR3P46671 204 aa2.35□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A RRN11Q04712 507 aa2.35□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A THP3Q12049 470 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A FAB1P34756 2278 aa2.34□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A FAU1P40099 211 aa2.34□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A SAP185P40856 1058 aa2.34□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A SIP4P46954 829 aa2.34□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A APT1P49435 187 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A AVT4P50944 713 aa2.34□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A ESA1Q08649 445 aa2.34□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A YPL272CQ08984 517 aa2.34□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A NBP2Q12163 236 aa2.34□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A EXO70P19658 623 aa2.33□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A CDC60P26637 1090 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A SSE2P32590 693 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A AUR1P36107 401 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A UTH1P36135 365 aa2.33□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A CIN4P39110 191 aa2.33□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A GCD10P41814 478 aa2.33□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A LCL3P53153 274 aa2.33□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A GPI1P53306 609 aa2.33□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A TSR1Q07381 788 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A RKM5Q12367 367 aa2.33□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A MF(ALPHA)1P01149 165 aa2.32□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A MRP13P12686 339 aa2.32□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A SUI2P20459 304 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A NAT2P37293 288 aa2.32□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A TIF4631P39935 952 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A REE1P40893 198 aa2.32□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A CAF40P53829 373 aa2.32□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A GOR1P53839 350 aa2.32□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A TOF1P53840 1238 aa2.32□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A COQ9Q05779 260 aa2.32□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A RVS161P25343 265 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A ARO2P28777 376 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A FRE2P36033 711 aa2.31□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A PIM1P36775 1133 aa2.31□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A DUG2P38149 878 aa2.31□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A TCM62P38228 572 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A YGR021WP53212 290 aa2.31□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A ART5P53244 586 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A CBK1P53894 756 aa2.31□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A RBS1Q05672 457 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A THP1Q08231 455 aa2.31□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A SPE4Q12455 300 aa2.31□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A SGS1P35187 1447 aa2.31□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A MES1P00958 751 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A SUP35P05453 685 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A GLK1P17709 500 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A PCL1P24867 279 aa2.3□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A SHP1P34223 423 aa2.3□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A BNA4P38169 460 aa2.3□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A AFG3P39925 761 aa2.3□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A RRT5P43607 289 aa2.3□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A YML037CQ03703 340 aa2.3□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A BUD22Q04347 519 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A KAR3P17119 729 aa2.29□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A ELO2P25358 347 aa2.29□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A POL4P25615 582 aa2.29□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A NDI1P32340 513 aa2.29□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A GLC7P32598 312 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A PTH2P34222 208 aa2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32 ms