RNA–Protein interactions for RNA: YKR081C

RPF2, Transcript of Essential protein involved in rRNA maturation and ribosomal assembly, yeast

Gene RPF2, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPF2	YKR081C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	MRP13	P12686	339 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	FRE1	P32791	686 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	SEF1	P34228	1148 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	IVY1	Q04934	453 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	YEH1	Q07804	573 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	SEM1	O94742	89 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	SUC2	P00724	532 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	HEM2	P05373	342 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	PAH1	P32567	862 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	SHP1	P34223	423 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	PMU1	P36069	295 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	SHO1	P40073	367 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	ALG5	P40350	334 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	IDP2	P41939	412 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	VPS74	Q06385	345 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	YPT6	Q99260	215 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	EXO70	P19658	623 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	UTR4	P32626	227 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	TUL1	P36096	758 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	ALG8	P40351	577 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	YPI1	P43587	155 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	IPI3	P53877	555 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	TOF2	Q02208	771 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	IRC15	Q02733	499 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	THP1	Q08231	455 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	YCR022C	P25620	114 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	PCA1	P38360	1216 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	COQ9	Q05779	260 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	PHO92	Q06390	306 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	DUG2	P38149	878 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	BNA4	P38169	460 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	SMA2	Q04658	369 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	MSR1	P38714	643 aa		4	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	HAT2	P39984	401 aa		4	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	ELP2	P42935	788 aa		4	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	YGL242C	P53066	181 aa		4	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	GPI1	P53306	609 aa		4	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	FIN1	Q03898	291 aa		4	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	RCN2	Q12044	265 aa		4	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	ENT1	Q12518	454 aa		4	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	PMR1	P13586	950 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	ELO2	P25358	347 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	MSN2	P33748	704 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	VID27	P40157	782 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	SPG5	P42933	373 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	AIM22	P47051	409 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	YGR066C	P53242	292 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	HNT3	Q08702	217 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	YDR056C	Q12025	205 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	RLM1	Q12224	676 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	AAC3	P18238	307 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	SAN1	P22470	610 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	GWT1	P47026	490 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	CTI6	Q08923	506 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	AVL9	Q12500	764 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	CTF3	Q12748	733 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	REG2	P38232	338 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	MRX6	P48564	524 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	WSC2	P53832	503 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	VPS38	Q05919	439 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPF2	YKR081C	REV1	P12689	985 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPF2	YKR081C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPF2	YKR081C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPF2	YKR081C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPF2	YKR081C	PRD1	P25375	712 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPF2	YKR081C	YME1	P32795	747 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPF2	YKR081C	MUM2	P38236	366 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPF2	YKR081C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPF2	YKR081C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPF2	YKR081C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPF2	YKR081C	COR1	P07256	457 aa		3.95	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25 ms