RNA–Protein interactions for RNA: YJL019W

MPS3, Transcript of Nuclear envelope protein, yeast

Gene MPS3, Length 2,049 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MPS3	YJL019W	EMC1	P25574	760 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YJU3	P28321	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	CDC5	P32562	705 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	MRPL6	P32904	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	STB6	P36085	766 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	MRP21	P38175	177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	MTG2	P38860	518 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YAR028W	P39548	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	PRM9	P39551	298 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	HAT2	P39984	401 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	DDI1	P40087	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	HST3	P53687	447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	IBD2	P53892	351 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SLG1	P54867	378 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	MUK1	Q02866	612 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ISU1	Q03020	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YML131W	Q03102	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	TRS31	Q03337	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	CDD1	Q06549	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	MCP2	Q06567	569 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	FRT1	Q99332	602 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	CCP1	P00431	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	HIS3	P06633	220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	HMG1	P12683	1054 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	CAP2	P13517	287 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YCL049C	P25577	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	BEM1	P29366	551 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	CAF4	P36130	643 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	MRPL7	P36519	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GPX2	P38143	162 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ATG14	P38270	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SFB3	P38810	929 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	CCT6	P39079	546 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	VMA7	P39111	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YEL028W	P39989	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RIM21	P48565	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	NCS6	P53088	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SNF12	P53628	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	CPR8	P53728	308 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
MPS3	YJL019W	YAF9	P53930	226 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SIW14	P53965	281 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	KTR6	P54070	446 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ARP4	P80428	489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SMA1	Q02651	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	DML1	Q03652	475 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YPS7	Q06325	596 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GPM2	Q12008	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	TIM9	O74700	87 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ARG81	P05085	880 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	PHO3	P24031	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	STE14	P32584	239 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	PTM1	P32857	523 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SKT5	P34226	696 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	MUP3	P38734	546 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YHR219W	P38900	624 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	MTW1	P39731	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	VAB2	P40003	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SNX4	P47057	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YJR115W	P47152	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	BOL2	P53082	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	TAF12	Q03761	539 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	APC5	Q08683	685 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RAX1	Q08760	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	NBP2	Q12163	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RBD2	Q12270	262 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RTR2	Q12378	196 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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