RNA–Protein interactions for RNA: YHR089C

GAR1, Transcript of Protein component of the H/ACA snoRNP pseudouridylase complex, yeast

Gene GAR1, Length 618 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GAR1	YHR089C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	RNQ1	P25367	405 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	HXT4	P32467	576 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	ARA1	P38115	344 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	ERP5	P38819	212 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	HXT7	P39004	570 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	YEN1	P40028	759 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	FET5	P43561	622 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	SDH1	Q00711	640 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	TRP3	P00937	484 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	BMT2	P38278	337 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	RFC3	P38629	340 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	YHR033W	P38690	423 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	NAS6	P50086	228 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	YEH2	Q07950	538 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	RKM5	Q12367	367 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	MEI5	P32489	222 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	EMC3	P36039	253 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	YBR071W	P38243	211 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	ARN1	P38731	627 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	PIN2	Q12057	282 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	OCA4	P25366	362 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	DOM34	P33309	386 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	LRO1	P40345	661 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	MET12	P46151	657 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	MPS1	P54199	764 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	BNA5	Q05979	453 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	FAR10	Q06001	478 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	OXP1	P28273	1286 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	KKQ8	P36004	724 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	13.56	□□□□□ -0.24	not detected
GAR1	YHR089C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	YGR053C	P53234	283 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	UBP2	Q01476	1272 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	GIP3	Q03016	1276 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	YLR111W	Q12528	110 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	RAD14	P28519	371 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	TOA1	P32773	286 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	PTC1	P35182	281 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	FRE2	P36033	711 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	CAF4	P36130	643 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	RGA1	P39083	1007 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	PLB1	P39105	664 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	FRT2	P39734	528 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	KXD1	P53158	218 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	YLR413W	Q06689	675 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	UAF30	Q08747	228 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	HAL9	Q12180	1030 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	CMP2	P14747	604 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.54	□□□□□ -0.24	RIP-Chip
GAR1	YHR089C	SFC1	P33303	322 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	SKN1	P33336	771 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	YDR124W	Q04608	324 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	YOR114W	Q12219	294 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	YDR262W	Q12331	272 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	STE14	P32584	239 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	YBL029W	P38201	376 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	CAB2	P40506	365 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	MNT3	P40549	630 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	YJL049W	P47048	450 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	RTS3	P53289	263 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	DIN7	Q12086	430 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GAR1	YHR089C	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GAR1	YHR089C	DST1	P07273	309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GAR1	YHR089C	TRX3	P25372	127 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GAR1	YHR089C	MLS1	P30952	554 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GAR1	YHR089C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GAR1	YHR089C	FTH1	P38310	465 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GAR1	YHR089C	TSC10	P38342	320 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GAR1	YHR089C	AZF1	P41696	914 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GAR1	YHR089C	PTR3	P43606	678 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GAR1	YHR089C	IMA1	P53051	589 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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