RNA–Protein interactions for RNA: YGL145W

TIP20, Transcript of Peripheral membrane protein required for COPI vesicle fusion to the ER, yeast

Gene TIP20, Length 2,106 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIP20	YGL145W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	BOS1	P25385	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	ICS2	P38284	255 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	PTR3	P43606	678 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	SFG1	Q12507	346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	NUP170	P38181	1502 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	CHO1	P08456	276 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	GRR1	P24814	1151 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	VHS2	P40463	436 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	ASG1	P40467	964 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	SPP41	P38904	1435 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	ALG7	P07286	448 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	IME2	P32581	645 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	ANS1	P38832	159 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	YGL108C	P53139	140 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	COQ6	P53318	479 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	OCA2	P53949	197 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	SLG1	P54867	378 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	MSC3	Q05812	728 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	VAM3	Q12241	283 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	YLR358C	O13565	187 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	STE11	P23561	717 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	PTC6	P25646	442 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	HIR2	P32480	875 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	PPS1	P38148	807 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	PIH1	P38768	344 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	ARO10	Q06408	635 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	CYK3	Q07533	885 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	STE3	P06783	470 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	WHI2	P12611	486 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	ARA1	P38115	344 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	ATG27	P46989	271 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	YPR003C	P53394	754 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	RNT1	Q02555	471 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	WAR1	Q03631	944 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	DCS1	Q06151	350 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
TIP20	YGL145W	NTO1	Q12311	748 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	GAC1	P28006	793 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	GMH1	P36125	273 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	VPS45	P38932	577 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	MBB1	P39534	108 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	MIT1	P40002	666 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	ARP5	P53946	755 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	VPS20	Q04272	221 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	YFH1	Q07540	174 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	MTR10	Q99189	972 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIP20	YGL145W	STH1	P32597	1359 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	CBP1	P07252	654 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	SPS4	P09937	338 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	RAD14	P28519	371 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	MRPL9	P31334	269 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	ARP1	P38696	384 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	CIN4	P39110	191 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	SHE10	P53075	577 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	MED2	Q12124	431 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	MLP2	P40457	1679 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	COR1	P07256	457 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	SPE2	P21182	396 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	LIP5	P32875	414 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	TOD6	P34219	525 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	AGX1	P43567	385 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	YFL015C	P43578	164 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	PHO23	P50947	330 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIP20	YGL145W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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