RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490566.1

TNS1-217, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-217ENST00000490566 CCDC34Q96HJ3 373 aa11.76□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.76□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 HSD3B7Q9H2F3 369 aa11.76□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.76□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 FAM196BA6NMK8 535 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 LAD1O00515 517 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 MYO1BO43795 1136 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 SMC2O95347 1197 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 PRPHP41219 470 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 CCDC144BQ3MJ40 725 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 CCDC186Q7Z3E2 898 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 MKL1Q969V6 931 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 PAGE5Q96GU1 130 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 VAT1LQ9HCJ6 419 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 NYAP2Q9P242 653 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 NRBP1Q9UHY1 535 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 ADCY7P51828 1080 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 DPYDQ12882 1025 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 CCDC96Q2M329 555 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 ADGRF4Q8IZF3 695 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 MLKLQ8NB16 471 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 DCAF4Q8WV16 495 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 MTMR8Q96EF0 704 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 GMLQ99445 158 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 TRIM34Q9BYJ4 488 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 VPS33BQ9H267 617 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 JMJD4Q9H9V9 463 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 SPTLC3Q9NUV7 552 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 DACH1Q9UI36 760 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 VIL1P09327 827 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 ATP2B2Q01814 1243 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 TTBK2Q6IQ55 1244 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 LARGE2Q8N3Y3 721 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 IQUBQ8NA54 791 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 KIAA1524Q8TCG1 905 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 PSMD14O00487 310 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 EEF2P13639 858 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 TXLNAP40222 546 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 AFMP43652 599 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 FANCCQ00597 558 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 DTHD1Q6ZMT9 781 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 NEK8Q86SG6 692 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 COA7Q96BR5 231 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 KANSL2Q9H9L4 492 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 IFNKQ9P0W0 207 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 SMCHD1A6NHR9 2005 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 GDF11O95390 407 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 OR52Z1P0C646 297 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 ICA1Q05084 483 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 SEPT2Q15019 361 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 ABCB5Q2M3G0 1257 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 TBCKQ8TEA7 893 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 GSDMAQ96QA5 445 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 RIC8AQ9NPQ8 531 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 TMEM260Q9NX78 707 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 CNTNAP1P78357 1384 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 USP17L10C9JJH3 530 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 ZBTB5O15062 677 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 NEMFO60524 1076 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 RAD17O75943 681 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 ATP1A3P13637 1013 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 CASP1P29466 404 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 LRMPQ12912 555 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 LETM2Q2VYF4 491 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 SLFN13Q68D06 897 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 KCTD1Q719H9 257 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 SIAH1Q8IUQ4 282 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-217ENST00000490566 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.3 ms