RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrvi1Q9WUX5 899 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bpifb4A2BGH0 617 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Capza3P70190 299 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp4cP97470 307 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc114Q3UX62 658 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hook2Q7TMK6 716 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdk8Q8R3L8 464 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cd274Q9EP73 290 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpf2Q9JJ80 306 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GsdmeQ9Z2D3 512 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stim2P83093 746 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eya3P97480 510 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 VrtnQ3SYK4 740 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spg7Q3ULF4 781 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sec31aQ3UPL0 1230 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vipas39Q8BGQ1 491 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdk17Q8K0D0 523 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tldc1Q8K0P3 455 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Onecut3Q8K557 490 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cmtr1Q9DBC3 837 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Jag1Q9QXX0 1218 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfyve9A2A8R0 1397 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slurp2P0DP59 97 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Asic3Q6X1Y6 530 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cct8l1Q80YT3 562 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AdpgkQ8VDL4 496 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pip4k2aO70172 405 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vcpip1Q8CDG3 1220 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rab3il1Q8VDV3 383 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm30191A0A0U1RNT7 187 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ErmardE9Q048 622 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klra1P20937 262 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rhpn1Q61085 643 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Shc3Q61120 474 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Maip1Q8BHE8 291 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prl7b1Q8CGZ9 251 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lzts2Q91YU6 671 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plagl2Q925T4 496 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hnrnph3D3Z3N4 346 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aknad1E9Q8N6 675 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Folh1O35409 752 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kifap3P70188 793 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arid3aQ62431 601 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eif4a3Q91VC3 411 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Glrx3Q9CQM9 337 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnajc19Q9CQV7 116 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Psma7Q9Z2U0 248 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DnttP09838 530 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrfip1Q3UZ39 729 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kremen1Q99N43 473 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serpinb12Q9D7P9 423 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ndst4Q9EQW8 872 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scn9aQ62205 1984 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm1993A6X8I0 212 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SlxD3Z347 212 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lig1P37913 916 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc12a2P55012 1205 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gcnt1Q09324 428 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif22Q3V300 660 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cep70Q6IQY5 616 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Exoc8Q6PGF7 716 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NkrfQ8BY02 690 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TbcbQ9D1E6 244 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ica1lQ3TY65 431 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 EregQ61521 162 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krit1Q6S5J6 736 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hirip3Q8BLH7 601 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Usp15Q8R5H1 981 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adcy3Q8VHH7 1145 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lztfl1Q9JHQ5 299 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Myo1cQ9WTI7 1063 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gna11P21278 359 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmed8Q3UHI4 326 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Islr2Q5RKR3 745 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sdccag8Q80UF4 717 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Camsap3Q80VC9 1252 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eno4Q8C042 619 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrc41Q8K1C9 807 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnajc17Q91WT4 303 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FignQ9ERZ6 759 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slfn1Q9Z0I7 337 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zscan18E9PUD6 809 aa18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MyrflQ3UN70 904 aa18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankrd24Q80VM7 985 aa18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Usp27Q8CEG8 438 aa18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ubxn6Q99PL6 442 aa18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eef1gQ9D8N0 437 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trmt112Q9DCG9 125 aa18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klrc1Q9Z202 244 aa18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm7168A0AUV4 508 aa18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Apol6B7ZC55 329 aa18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Qtrt2B8ZXI1 415 aa18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14 ms