Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Vipas39Q8BGQ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Vipas39Q8BGQ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Vipas39Q8BGQ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Vipas39Q8BGQ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Vipas39Q8BGQ1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Vipas39Q8BGQ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Vipas39Q8BGQ1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Vipas39Q8BGQ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Vipas39Q8BGQ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Vipas39Q8BGQ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Vipas39Q8BGQ1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Vipas39Q8BGQ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Vipas39Q8BGQ1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Vipas39Q8BGQ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Vipas39Q8BGQ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Vipas39Q8BGQ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Vipas39Q8BGQ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Vipas39Q8BGQ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Vipas39Q8BGQ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Vipas39Q8BGQ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Vipas39Q8BGQ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Vipas39Q8BGQ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Vipas39Q8BGQ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Vipas39Q8BGQ1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Vipas39Q8BGQ1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Vipas39Q8BGQ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Vipas39Q8BGQ1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Vipas39Q8BGQ1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Vipas39Q8BGQ1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Vipas39Q8BGQ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Vipas39Q8BGQ1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Vipas39Q8BGQ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Vipas39Q8BGQ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Vipas39Q8BGQ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Vipas39Q8BGQ1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Vipas39Q8BGQ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Vipas39Q8BGQ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Vipas39Q8BGQ1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Vipas39Q8BGQ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Vipas39Q8BGQ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Vipas39Q8BGQ1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Vipas39Q8BGQ1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Vipas39Q8BGQ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Vipas39Q8BGQ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Vipas39Q8BGQ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Vipas39Q8BGQ1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Vipas39Q8BGQ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Vipas39Q8BGQ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Vipas39Q8BGQ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Vipas39Q8BGQ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Vipas39Q8BGQ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Vipas39Q8BGQ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Vipas39Q8BGQ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Vipas39Q8BGQ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Vipas39Q8BGQ1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Vipas39Q8BGQ1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vipas39Q8BGQ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vipas39Q8BGQ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Vipas39Q8BGQ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Vipas39Q8BGQ1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Vipas39Q8BGQ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Vipas39Q8BGQ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Vipas39Q8BGQ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Vipas39Q8BGQ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Vipas39Q8BGQ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Vipas39Q8BGQ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Vipas39Q8BGQ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Vipas39Q8BGQ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Vipas39Q8BGQ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vipas39Q8BGQ1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Vipas39Q8BGQ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vipas39Q8BGQ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vipas39Q8BGQ1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vipas39Q8BGQ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Vipas39Q8BGQ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Vipas39Q8BGQ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vipas39Q8BGQ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Vipas39Q8BGQ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Vipas39Q8BGQ1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vipas39Q8BGQ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vipas39Q8BGQ1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Vipas39Q8BGQ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vipas39Q8BGQ1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vipas39Q8BGQ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vipas39Q8BGQ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vipas39Q8BGQ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vipas39Q8BGQ1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Vipas39Q8BGQ1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vipas39Q8BGQ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vipas39Q8BGQ1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vipas39Q8BGQ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vipas39Q8BGQ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vipas39Q8BGQ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Vipas39Q8BGQ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Vipas39Q8BGQ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms