Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,39■■■■□ 3,58
Ccdc114Q3UX62 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Ccdc114Q3UX62 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Ccdc114Q3UX62 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Ccdc114Q3UX62 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Ccdc114Q3UX62 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Ccdc114Q3UX62 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,08■■■■□ 3,05
Ccdc114Q3UX62 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Ccdc114Q3UX62 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Ccdc114Q3UX62 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33■■■□□ 2,87
Ccdc114Q3UX62 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Ccdc114Q3UX62 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Ccdc114Q3UX62 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Ccdc114Q3UX62 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Ccdc114Q3UX62 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Ccdc114Q3UX62 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Ccdc114Q3UX62 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,27■■■□□ 2,76
Ccdc114Q3UX62 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Ccdc114Q3UX62 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,22■■■□□ 2,75
Ccdc114Q3UX62 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Ccdc114Q3UX62 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,97■■■□□ 2,71
Ccdc114Q3UX62 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Ccdc114Q3UX62 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,94■■■□□ 2,7
Ccdc114Q3UX62 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Ccdc114Q3UX62 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Ccdc114Q3UX62 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Ccdc114Q3UX62 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Ccdc114Q3UX62 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Ccdc114Q3UX62 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Ccdc114Q3UX62 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Ccdc114Q3UX62 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,32■■■□□ 2,6
Ccdc114Q3UX62 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Ccdc114Q3UX62 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Ccdc114Q3UX62 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Ccdc114Q3UX62 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Ccdc114Q3UX62 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,07■■■□□ 2,56
Ccdc114Q3UX62 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Ccdc114Q3UX62 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Ccdc114Q3UX62 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,03■■■□□ 2,56
Ccdc114Q3UX62 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Ccdc114Q3UX62 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Ccdc114Q3UX62 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Ccdc114Q3UX62 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Ccdc114Q3UX62 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Ccdc114Q3UX62 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Ccdc114Q3UX62 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Ccdc114Q3UX62 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Ccdc114Q3UX62 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Ccdc114Q3UX62 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Ccdc114Q3UX62 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Ccdc114Q3UX62 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,53■■■□□ 2,48
Ccdc114Q3UX62 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Ccdc114Q3UX62 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Ccdc114Q3UX62 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Ccdc114Q3UX62 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Ccdc114Q3UX62 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Ccdc114Q3UX62 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Ccdc114Q3UX62 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
Ccdc114Q3UX62 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Ccdc114Q3UX62 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Ccdc114Q3UX62 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ccdc114Q3UX62 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Ccdc114Q3UX62 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ccdc114Q3UX62 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Ccdc114Q3UX62 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ccdc114Q3UX62 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Ccdc114Q3UX62 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Ccdc114Q3UX62 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Ccdc114Q3UX62 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Ccdc114Q3UX62 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Ccdc114Q3UX62 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Ccdc114Q3UX62 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ccdc114Q3UX62 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
Ccdc114Q3UX62 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Ccdc114Q3UX62 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ccdc114Q3UX62 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Ccdc114Q3UX62 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Ccdc114Q3UX62 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ccdc114Q3UX62 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ccdc114Q3UX62 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ccdc114Q3UX62 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ccdc114Q3UX62 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Ccdc114Q3UX62 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Ccdc114Q3UX62 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ccdc114Q3UX62 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ccdc114Q3UX62 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Ccdc114Q3UX62 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Ccdc114Q3UX62 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Ccdc114Q3UX62 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Ccdc114Q3UX62 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ccdc114Q3UX62 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ccdc114Q3UX62 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ccdc114Q3UX62 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ccdc114Q3UX62 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Ccdc114Q3UX62 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Ccdc114Q3UX62 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Ccdc114Q3UX62 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Ccdc114Q3UX62 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,4 ms