Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,53■■■■□ 3,6
Klra1P20937 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Klra1P20937 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Klra1P20937 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,05■■■■□ 3,2
Klra1P20937 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Klra1P20937 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Klra1P20937 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Klra1P20937 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Klra1P20937 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,87■■■■□ 3,01
Klra1P20937 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Klra1P20937 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,52■■■□□ 2,96
Klra1P20937 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Klra1P20937 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,95■■■□□ 2,87
Klra1P20937 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Klra1P20937 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,75■■■□□ 2,83
Klra1P20937 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Klra1P20937 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Klra1P20937 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Klra1P20937 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,21■■■□□ 2,75
Klra1P20937 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Klra1P20937 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Klra1P20937 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Klra1P20937 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Klra1P20937 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Klra1P20937 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Klra1P20937 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Klra1P20937 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,83■■■□□ 2,69
Klra1P20937 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Klra1P20937 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Klra1P20937 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Klra1P20937 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Klra1P20937 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,57■■■□□ 2,64
Klra1P20937 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Klra1P20937 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Klra1P20937 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Klra1P20937 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,42■■■□□ 2,62
Klra1P20937 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Klra1P20937 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Klra1P20937 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Klra1P20937 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Klra1P20937 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Klra1P20937 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Klra1P20937 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Klra1P20937 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,57
Klra1P20937 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Klra1P20937 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Klra1P20937 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Klra1P20937 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,88■■■□□ 2,53
Klra1P20937 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Klra1P20937 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Klra1P20937 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Klra1P20937 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,78■■■□□ 2,52
Klra1P20937 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Klra1P20937 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Klra1P20937 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Klra1P20937 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,6■■■□□ 2,49
Klra1P20937 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Klra1P20937 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Klra1P20937 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Klra1P20937 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Klra1P20937 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Klra1P20937 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Klra1P20937 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,14■■■□□ 2,42
Klra1P20937 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Klra1P20937 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Klra1P20937 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Klra1P20937 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Klra1P20937 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Klra1P20937 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Klra1P20937 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Klra1P20937 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Klra1P20937 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Klra1P20937 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Klra1P20937 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Klra1P20937 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Klra1P20937 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Klra1P20937 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Klra1P20937 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Klra1P20937 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Klra1P20937 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Klra1P20937 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Klra1P20937 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Klra1P20937 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Klra1P20937 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
Klra1P20937 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Klra1P20937 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Klra1P20937 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Klra1P20937 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
Klra1P20937 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Klra1P20937 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Klra1P20937 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Klra1P20937 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Klra1P20937 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Klra1P20937 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Klra1P20937 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Klra1P20937 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Klra1P20937 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Klra1P20937 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Klra1P20937 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Klra1P20937 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,8 ms