Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
Apol6B7ZC55 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Apol6B7ZC55 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Apol6B7ZC55 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Apol6B7ZC55 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Apol6B7ZC55 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Apol6B7ZC55 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Apol6B7ZC55 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Apol6B7ZC55 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Apol6B7ZC55 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Apol6B7ZC55 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Apol6B7ZC55 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Apol6B7ZC55 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Apol6B7ZC55 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Apol6B7ZC55 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Apol6B7ZC55 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Apol6B7ZC55 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Apol6B7ZC55 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Apol6B7ZC55 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Apol6B7ZC55 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Apol6B7ZC55 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Apol6B7ZC55 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Apol6B7ZC55 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Apol6B7ZC55 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Apol6B7ZC55 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Apol6B7ZC55 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Apol6B7ZC55 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Apol6B7ZC55 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Apol6B7ZC55 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Apol6B7ZC55 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Apol6B7ZC55 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Apol6B7ZC55 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Apol6B7ZC55 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Apol6B7ZC55 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Apol6B7ZC55 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Apol6B7ZC55 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Apol6B7ZC55 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Apol6B7ZC55 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Apol6B7ZC55 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Apol6B7ZC55 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Apol6B7ZC55 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Apol6B7ZC55 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Apol6B7ZC55 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Apol6B7ZC55 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Apol6B7ZC55 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Apol6B7ZC55 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Apol6B7ZC55 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Apol6B7ZC55 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Apol6B7ZC55 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Apol6B7ZC55 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Apol6B7ZC55 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Apol6B7ZC55 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Apol6B7ZC55 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Apol6B7ZC55 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Apol6B7ZC55 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Apol6B7ZC55 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Apol6B7ZC55 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Apol6B7ZC55 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Apol6B7ZC55 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Apol6B7ZC55 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Apol6B7ZC55 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Apol6B7ZC55 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Apol6B7ZC55 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Apol6B7ZC55 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Apol6B7ZC55 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Apol6B7ZC55 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Apol6B7ZC55 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Apol6B7ZC55 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Apol6B7ZC55 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Apol6B7ZC55 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Apol6B7ZC55 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Apol6B7ZC55 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Apol6B7ZC55 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Apol6B7ZC55 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Apol6B7ZC55 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Apol6B7ZC55 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Apol6B7ZC55 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Apol6B7ZC55 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Apol6B7ZC55 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Apol6B7ZC55 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Apol6B7ZC55 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Apol6B7ZC55 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Apol6B7ZC55 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Apol6B7ZC55 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Apol6B7ZC55 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Apol6B7ZC55 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Apol6B7ZC55 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Apol6B7ZC55 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Apol6B7ZC55 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Apol6B7ZC55 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Apol6B7ZC55 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Apol6B7ZC55 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Apol6B7ZC55 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Apol6B7ZC55 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Apol6B7ZC55 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Apol6B7ZC55 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Apol6B7ZC55 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Apol6B7ZC55 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Apol6B7ZC55 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Apol6B7ZC55 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms