Protein–RNA interactions for Protein: O70172

Pip4k2a, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2aO70172 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,78■■■■□ 3,8
Pip4k2aO70172 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
Pip4k2aO70172 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Pip4k2aO70172 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,66■■■■□ 3,46
Pip4k2aO70172 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Pip4k2aO70172 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,34■■■■□ 3,25
Pip4k2aO70172 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Pip4k2aO70172 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Pip4k2aO70172 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,81■■■■□ 3,16
Pip4k2aO70172 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Pip4k2aO70172 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Pip4k2aO70172 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Pip4k2aO70172 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,13■■■■□ 3,05
Pip4k2aO70172 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,13■■■■□ 3,05
Pip4k2aO70172 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Pip4k2aO70172 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Pip4k2aO70172 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Pip4k2aO70172 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Pip4k2aO70172 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Pip4k2aO70172 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Pip4k2aO70172 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Pip4k2aO70172 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Pip4k2aO70172 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Pip4k2aO70172 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Pip4k2aO70172 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Pip4k2aO70172 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,15■■■□□ 2,9
Pip4k2aO70172 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,15■■■□□ 2,9
Pip4k2aO70172 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Pip4k2aO70172 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,95■■■□□ 2,87
Pip4k2aO70172 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Pip4k2aO70172 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Pip4k2aO70172 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Pip4k2aO70172 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Pip4k2aO70172 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Pip4k2aO70172 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Pip4k2aO70172 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,58■■■□□ 2,81
Pip4k2aO70172 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Pip4k2aO70172 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Pip4k2aO70172 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,45■■■□□ 2,79
Pip4k2aO70172 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,45■■■□□ 2,78
Pip4k2aO70172 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Pip4k2aO70172 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,36■■■□□ 2,77
Pip4k2aO70172 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Pip4k2aO70172 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Pip4k2aO70172 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Pip4k2aO70172 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Pip4k2aO70172 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Pip4k2aO70172 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Pip4k2aO70172 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,97■■■□□ 2,71
Pip4k2aO70172 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,96■■■□□ 2,71
Pip4k2aO70172 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Pip4k2aO70172 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Pip4k2aO70172 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Pip4k2aO70172 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Pip4k2aO70172 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,49■■■□□ 2,63
Pip4k2aO70172 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Pip4k2aO70172 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Pip4k2aO70172 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Pip4k2aO70172 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Pip4k2aO70172 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,3■■■□□ 2,6
Pip4k2aO70172 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Pip4k2aO70172 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Pip4k2aO70172 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,2■■■□□ 2,58
Pip4k2aO70172 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Pip4k2aO70172 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,57
Pip4k2aO70172 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Pip4k2aO70172 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Pip4k2aO70172 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Pip4k2aO70172 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Pip4k2aO70172 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Pip4k2aO70172 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Pip4k2aO70172 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Pip4k2aO70172 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Pip4k2aO70172 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Pip4k2aO70172 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Pip4k2aO70172 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Pip4k2aO70172 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Pip4k2aO70172 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Pip4k2aO70172 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Pip4k2aO70172 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,66■■■□□ 2,5
Pip4k2aO70172 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Pip4k2aO70172 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Pip4k2aO70172 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Pip4k2aO70172 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Pip4k2aO70172 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Pip4k2aO70172 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Pip4k2aO70172 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Pip4k2aO70172 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Pip4k2aO70172 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Pip4k2aO70172 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Pip4k2aO70172 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Pip4k2aO70172 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Pip4k2aO70172 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Pip4k2aO70172 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Pip4k2aO70172 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Pip4k2aO70172 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Pip4k2aO70172 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Pip4k2aO70172 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Pip4k2aO70172 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Pip4k2aO70172 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,6 ms