Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Usp27Q8CEG8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Usp27Q8CEG8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Usp27Q8CEG8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Usp27Q8CEG8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Usp27Q8CEG8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Usp27Q8CEG8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Usp27Q8CEG8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Usp27Q8CEG8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Usp27Q8CEG8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Usp27Q8CEG8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Usp27Q8CEG8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Usp27Q8CEG8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Usp27Q8CEG8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Usp27Q8CEG8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Usp27Q8CEG8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Usp27Q8CEG8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Usp27Q8CEG8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Usp27Q8CEG8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Usp27Q8CEG8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Usp27Q8CEG8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Usp27Q8CEG8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Usp27Q8CEG8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Usp27Q8CEG8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Usp27Q8CEG8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Usp27Q8CEG8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Usp27Q8CEG8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Usp27Q8CEG8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Usp27Q8CEG8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Usp27Q8CEG8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Usp27Q8CEG8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Usp27Q8CEG8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Usp27Q8CEG8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Usp27Q8CEG8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Usp27Q8CEG8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Usp27Q8CEG8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Usp27Q8CEG8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Usp27Q8CEG8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Usp27Q8CEG8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Usp27Q8CEG8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Usp27Q8CEG8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Usp27Q8CEG8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Usp27Q8CEG8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp27Q8CEG8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Usp27Q8CEG8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Usp27Q8CEG8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp27Q8CEG8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp27Q8CEG8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Usp27Q8CEG8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Usp27Q8CEG8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Usp27Q8CEG8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp27Q8CEG8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp27Q8CEG8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp27Q8CEG8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp27Q8CEG8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp27Q8CEG8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp27Q8CEG8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp27Q8CEG8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp27Q8CEG8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp27Q8CEG8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Usp27Q8CEG8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp27Q8CEG8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp27Q8CEG8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp27Q8CEG8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp27Q8CEG8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp27Q8CEG8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp27Q8CEG8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp27Q8CEG8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp27Q8CEG8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp27Q8CEG8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp27Q8CEG8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp27Q8CEG8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp27Q8CEG8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp27Q8CEG8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp27Q8CEG8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp27Q8CEG8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp27Q8CEG8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp27Q8CEG8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp27Q8CEG8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp27Q8CEG8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp27Q8CEG8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp27Q8CEG8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp27Q8CEG8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp27Q8CEG8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp27Q8CEG8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp27Q8CEG8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp27Q8CEG8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp27Q8CEG8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp27Q8CEG8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp27Q8CEG8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp27Q8CEG8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp27Q8CEG8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp27Q8CEG8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp27Q8CEG8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp27Q8CEG8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp27Q8CEG8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp27Q8CEG8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp27Q8CEG8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp27Q8CEG8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp27Q8CEG8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
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