RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P INA22P40576 216 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MAD1P40957 749 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PHB1P40961 287 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL320WP42840 284 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SAE2P46946 345 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ARH1P48360 493 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MPS2P53159 387 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR015CP53208 328 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PRO2P54885 456 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SED5Q01590 340 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PEX25Q02969 394 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P VTI1Q04338 217 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P BUD22Q04347 519 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR027WQ04371 470 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR338CQ05497 695 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RSC2Q06488 889 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD34Q06665 692 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P BDS1Q08347 646 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CUE5Q08412 411 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CYT1P07143 309 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P GPA2P10823 449 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P GUK1P15454 187 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ART10P18634 518 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PRP6P19735 899 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RPB4P20433 221 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TRX2P22803 104 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MXR2P25566 168 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P AAD3P25612 363 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CPR3P25719 182 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P NIP1P32497 812 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P GCG1P32656 232 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RIM101P33400 625 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PET112P33893 541 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P NUP120P35729 1037 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RRN3P36070 627 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P BYE1P36106 594 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P KAE1P36132 386 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SOL2P37262 315 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CBP4P37267 147 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YRO2P38079 344 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RRN10P38204 145 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MNN1P39106 762 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P DHH1P39517 506 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YJL206CP39529 758 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P NPT1P39683 429 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P FMP52P40008 231 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P VRG4P40107 337 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P NDE1P40215 560 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YIL086CP40503 102 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PAC11P40960 533 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL10P41805 221 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P VMA13P41807 478 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MIC19P43594 170 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YJR149WP47177 404 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ASK10P48361 1146 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ZIP2P53061 704 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MDM34P53083 459 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RTS3P53289 263 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YNR021WP53723 404 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL260CP53846 198 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MRS2Q01926 470 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RNY1Q02933 434 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RSM10Q03201 203 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P NHP10Q03435 203 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P NUP53Q03790 475 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TPP1Q03796 238 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P HPT1Q04178 221 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YET2Q04210 160 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RRB1Q04225 511 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SPO20Q04359 397 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PNP1Q05788 311 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RIF2Q06208 395 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P VAM6Q07468 1049 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TEN1Q07921 160 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YOL159CQ08300 171 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MMT2Q08970 484 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P IOC2Q12072 812 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P LEU9Q12166 604 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR011CQ12251 326 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YRM1Q12340 786 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CMR1Q12510 522 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR030W-AQ3E760 96 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YPT1P01123 206 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P RSR1P13856 272 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P HEM15P16622 393 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P ARG1P22768 420 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P TRX3P25372 127 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P KAR4P25583 335 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P NAM9P27929 486 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P KIP2P28743 706 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P RPC37P36121 282 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P LAS1P36146 502 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P MRPL15P36523 253 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P ETR1P38071 380 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P MUP3P38734 546 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P CAB2P40506 365 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P PRM2P40534 656 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P VNX1P42839 908 aa2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.6 ms