RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M INA22P40576 216 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MAD1P40957 749 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PHB1P40961 287 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL320WP42840 284 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SAE2P46946 345 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ARH1P48360 493 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MPS2P53159 387 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR015CP53208 328 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PRO2P54885 456 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SED5Q01590 340 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX25Q02969 394 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M VTI1Q04338 217 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M BUD22Q04347 519 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR027WQ04371 470 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR338CQ05497 695 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RSC2Q06488 889 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD34Q06665 692 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M BDS1Q08347 646 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CUE5Q08412 411 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CYT1P07143 309 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M GPA2P10823 449 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M GUK1P15454 187 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ART10P18634 518 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PRP6P19735 899 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RPB4P20433 221 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TRX2P22803 104 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MXR2P25566 168 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M AAD3P25612 363 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CPR3P25719 182 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M NIP1P32497 812 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M GCG1P32656 232 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RIM101P33400 625 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PET112P33893 541 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M NUP120P35729 1037 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RRN3P36070 627 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M BYE1P36106 594 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M KAE1P36132 386 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SOL2P37262 315 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CBP4P37267 147 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YRO2P38079 344 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RRN10P38204 145 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MNN1P39106 762 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M DHH1P39517 506 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YJL206CP39529 758 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M NPT1P39683 429 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M FMP52P40008 231 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M VRG4P40107 337 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M NDE1P40215 560 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YIL086CP40503 102 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PAC11P40960 533 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL10P41805 221 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M VMA13P41807 478 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MIC19P43594 170 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YJR149WP47177 404 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ASK10P48361 1146 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ZIP2P53061 704 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MDM34P53083 459 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RTS3P53289 263 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YNR021WP53723 404 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL260CP53846 198 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MRS2Q01926 470 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RNY1Q02933 434 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RSM10Q03201 203 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M NHP10Q03435 203 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M NUP53Q03790 475 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TPP1Q03796 238 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M HPT1Q04178 221 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YET2Q04210 160 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RRB1Q04225 511 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SPO20Q04359 397 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PNP1Q05788 311 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RIF2Q06208 395 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M VAM6Q07468 1049 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TEN1Q07921 160 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YOL159CQ08300 171 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MMT2Q08970 484 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M IOC2Q12072 812 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M LEU9Q12166 604 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YPR011CQ12251 326 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YRM1Q12340 786 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CMR1Q12510 522 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR030W-AQ3E760 96 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YPT1P01123 206 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M RSR1P13856 272 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M HEM15P16622 393 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M ARG1P22768 420 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M TRX3P25372 127 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M KAR4P25583 335 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M NAM9P27929 486 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M KIP2P28743 706 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M RPC37P36121 282 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M LAS1P36146 502 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL15P36523 253 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M ETR1P38071 380 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M MUP3P38734 546 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M CAB2P40506 365 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M PRM2P40534 656 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M VNX1P42839 908 aa2.52□□□□□ -2.01
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