RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K INA22P40576 216 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MAD1P40957 749 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PHB1P40961 287 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL320WP42840 284 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SAE2P46946 345 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ARH1P48360 493 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MPS2P53159 387 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YGR015CP53208 328 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PRO2P54885 456 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SED5Q01590 340 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PEX25Q02969 394 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K VTI1Q04338 217 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K BUD22Q04347 519 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR027WQ04371 470 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR338CQ05497 695 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RSC2Q06488 889 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD34Q06665 692 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K BDS1Q08347 646 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CUE5Q08412 411 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CYT1P07143 309 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K GPA2P10823 449 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K GUK1P15454 187 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ART10P18634 518 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PRP6P19735 899 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RPB4P20433 221 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TRX2P22803 104 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MXR2P25566 168 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K AAD3P25612 363 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CPR3P25719 182 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K NIP1P32497 812 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K GCG1P32656 232 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RIM101P33400 625 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PET112P33893 541 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K NUP120P35729 1037 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RRN3P36070 627 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K BYE1P36106 594 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K KAE1P36132 386 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SOL2P37262 315 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CBP4P37267 147 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YRO2P38079 344 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RRN10P38204 145 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MNN1P39106 762 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K DHH1P39517 506 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YJL206CP39529 758 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K NPT1P39683 429 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K FMP52P40008 231 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K VRG4P40107 337 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K NDE1P40215 560 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YIL086CP40503 102 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PAC11P40960 533 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL10P41805 221 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K VMA13P41807 478 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MIC19P43594 170 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YJR149WP47177 404 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ASK10P48361 1146 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ZIP2P53061 704 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MDM34P53083 459 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RTS3P53289 263 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YNR021WP53723 404 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL260CP53846 198 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MRS2Q01926 470 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RNY1Q02933 434 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RSM10Q03201 203 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K NHP10Q03435 203 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K NUP53Q03790 475 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TPP1Q03796 238 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K HPT1Q04178 221 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YET2Q04210 160 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RRB1Q04225 511 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SPO20Q04359 397 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PNP1Q05788 311 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RIF2Q06208 395 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K VAM6Q07468 1049 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TEN1Q07921 160 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YOL159CQ08300 171 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MMT2Q08970 484 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K IOC2Q12072 812 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K LEU9Q12166 604 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YPR011CQ12251 326 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YRM1Q12340 786 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CMR1Q12510 522 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR030W-AQ3E760 96 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YPT1P01123 206 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K RSR1P13856 272 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K HEM15P16622 393 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K ARG1P22768 420 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K TRX3P25372 127 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K KAR4P25583 335 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K NAM9P27929 486 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K KIP2P28743 706 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K RPC37P36121 282 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K LAS1P36146 502 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL15P36523 253 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K ETR1P38071 380 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K MUP3P38734 546 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K CAB2P40506 365 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K PRM2P40534 656 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K VNX1P42839 908 aa2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.7 ms