RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J INA22P40576 216 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MAD1P40957 749 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PHB1P40961 287 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL320WP42840 284 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SAE2P46946 345 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ARH1P48360 493 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MPS2P53159 387 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR015CP53208 328 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PRO2P54885 456 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SED5Q01590 340 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX25Q02969 394 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J VTI1Q04338 217 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J BUD22Q04347 519 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR027WQ04371 470 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR338CQ05497 695 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RSC2Q06488 889 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD34Q06665 692 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J BDS1Q08347 646 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CUE5Q08412 411 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CYT1P07143 309 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J GPA2P10823 449 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J GUK1P15454 187 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ART10P18634 518 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PRP6P19735 899 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RPB4P20433 221 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TRX2P22803 104 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MXR2P25566 168 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J AAD3P25612 363 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CPR3P25719 182 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J NIP1P32497 812 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J GCG1P32656 232 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RIM101P33400 625 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PET112P33893 541 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J NUP120P35729 1037 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RRN3P36070 627 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J BYE1P36106 594 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J KAE1P36132 386 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SOL2P37262 315 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CBP4P37267 147 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YRO2P38079 344 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RRN10P38204 145 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MNN1P39106 762 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J DHH1P39517 506 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL206CP39529 758 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J NPT1P39683 429 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J FMP52P40008 231 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J VRG4P40107 337 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J NDE1P40215 560 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL086CP40503 102 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PAC11P40960 533 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL10P41805 221 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J VMA13P41807 478 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MIC19P43594 170 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR149WP47177 404 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ASK10P48361 1146 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ZIP2P53061 704 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MDM34P53083 459 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RTS3P53289 263 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YNR021WP53723 404 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL260CP53846 198 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MRS2Q01926 470 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RNY1Q02933 434 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RSM10Q03201 203 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J NHP10Q03435 203 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J NUP53Q03790 475 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TPP1Q03796 238 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J HPT1Q04178 221 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YET2Q04210 160 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RRB1Q04225 511 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SPO20Q04359 397 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PNP1Q05788 311 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RIF2Q06208 395 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J VAM6Q07468 1049 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TEN1Q07921 160 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL159CQ08300 171 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MMT2Q08970 484 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J IOC2Q12072 812 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J LEU9Q12166 604 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR011CQ12251 326 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YRM1Q12340 786 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CMR1Q12510 522 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR030W-AQ3E760 96 aa2.53□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YPT1P01123 206 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RSR1P13856 272 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HEM15P16622 393 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ARG1P22768 420 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J TRX3P25372 127 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J KAR4P25583 335 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J NAM9P27929 486 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J KIP2P28743 706 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RPC37P36121 282 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J LAS1P36146 502 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL15P36523 253 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ETR1P38071 380 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MUP3P38734 546 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J CAB2P40506 365 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PRM2P40534 656 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J VNX1P42839 908 aa2.52□□□□□ -2.01
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