RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C TEN1Q07921 160 aa6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C MCA1Q08601 432 aa6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C YPL272CQ08984 517 aa6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C ATG29Q12092 213 aa6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C HAL9Q12180 1030 aa6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C PST1Q12355 444 aa6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C GPA2P10823 449 aa6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C RSR1P13856 272 aa6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C AMS1P22855 1083 aa6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C LST4P34239 828 aa6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C SEC28P40509 296 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C YJR149WP47177 404 aa6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C TRM9P49957 279 aa6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C ERG26P53199 349 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C YGR012WP53206 393 aa6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C COG6P53959 839 aa6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C SLT2Q00772 484 aa6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C SED5Q01590 340 aa6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C MRS2Q01926 470 aa6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C UTP13Q05946 817 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C IOC2Q12072 812 aa6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C YOR114WQ12219 294 aa6.74□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C CMD1P06787 147 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C SPO16P17122 198 aa6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C RIM1P32445 135 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C NIP1P32497 812 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C UBC6P33296 250 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C EFM1P38732 585 aa6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C NDE1P40215 560 aa6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C ATG36P46983 293 aa6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data6.73□□□□□ -1.33not detected
SPE3YPR069C PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C BOL2P53082 120 aa6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C NNF2P53253 936 aa6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C BUD32P53323 261 aa6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C GAD1Q04792 585 aa6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C ADE13Q05911 482 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C YDR056CQ12025 205 aa6.73□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C CDC21P06785 304 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C SEC53P07283 254 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C KIN2P13186 1147 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C PET123P17558 318 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C TRX2P22803 104 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C EHT1P38295 451 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C INM1P38710 295 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C MUP3P38734 546 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C CHS7P38843 316 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C MNL1P38888 796 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C GGC1P38988 300 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C NPT1P39683 429 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C MGS1P40151 587 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C NDC80P40460 691 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C MNT3P40549 630 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C IBA57P47158 497 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C YGL260WP53056 76 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C MDM34P53083 459 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C SPO20Q04359 397 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C YMR027WQ04371 470 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C ROY1Q04847 553 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C BCH1Q05029 724 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C GIC2Q06648 383 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C ATG23Q06671 453 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C YPR022CQ12139 1133 aa6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C RIO1Q12196 484 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C COX1P00401 534 aa6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YPT1P01123 206 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C KAR1P11927 433 aa6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C CDC26P14724 124 aa6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C HEM15P16622 393 aa6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C ADE1P27616 306 aa6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C MKK2P32491 506 aa6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C KAP122P32767 1081 aa6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C UGP1P32861 499 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YHR112CP38716 378 aa6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C CCT4P39078 528 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C STB2P46679 850 aa6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C GCD14P46959 383 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YJR030CP47101 745 aa6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C TIS11P47977 285 aa6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C CLD1P53264 445 aa6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C MCM16Q12262 181 aa6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C STE3P06783 470 aa6.7□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C BAS1P22035 811 aa6.7□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C ADH7P25377 361 aa6.7□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C GCD11P32481 527 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C ORC2P32833 620 aa6.7□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YKL100CP34248 587 aa6.7□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C KKQ8P36004 724 aa6.7□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C SER3P40054 469 aa6.7□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C HST2P53686 357 aa6.7□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C GOT1Q03554 138 aa6.7□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C TPP1Q03796 238 aa6.7□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C DFG5Q05031 458 aa6.7□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C MDM30Q05930 598 aa6.7□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C AMD2P22580 549 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15 ms