RNA–Protein interactions for RNA: YPR058W

YMC1, Transcript of Putative mitochondrial inner membrane transporter, yeast

Gene YMC1, Length 924 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMC1	YPR058W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	DUN1	P39009	513 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	MET18	P40469	1032 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	FMP33	P46998	180 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	IMA1	P53051	589 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	SHY1	P53266	389 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	PRM1	P53835	661 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	PPN1	Q04119	674 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	DYN3	Q04949	312 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	YLR413W	Q06689	675 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	VAM6	Q07468	1049 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	UAF30	Q08747	228 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	BUD7	Q08754	746 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	YLR049C	Q12110	428 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	NSL1	Q12143	216 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	PER33	Q12144	273 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	MCD1	Q12158	566 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	GTT2	Q12390	233 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	NHA1	Q99271	985 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	SPT3	P06844	337 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	COS2	P0CX12	379 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	COS3	P0CX13	379 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	STE6	P12866	1290 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	RSR1	P13856	272 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	KIN3	P22209	435 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	YKL100C	P34248	587 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	AST1	P35183	429 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	LRG1	P35688	1017 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	YBL029W	P38201	376 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	GIP1	P38229	639 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	IRR1	P40541	1150 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	COS4	P43542	379 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	GLG2	P47011	380 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	MPS3	P47069	682 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	NNF1	P47149	201 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	YJR154W	P47181	346 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	MNT2	P53059	558 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	SPC2	Q04969	178 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	RIF2	Q06208	395 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	PSR1	Q07800	427 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	GPB1	Q08886	897 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	SAS5	Q99314	248 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YMC1	YPR058W	YAK1	P14680	807 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	URA4	P20051	364 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	CLB4	P24871	460 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	BRF1	P29056	596 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	COX13	P32799	129 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	TIP20	P33891	701 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	CYC2	P38909	366 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	BEM4	P39011	633 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	PIK1	P39104	1066 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	HPM1	P40481	377 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	IMA5	P40884	581 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	GCD10	P41814	478 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	NAS6	P50086	228 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	DIA3	P52290	468 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	FLC3	P53121	802 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	YGR016W	P53209	190 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	YGR053C	P53234	283 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	PEX13	P80667	386 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.08	□□□□□ -1.44	not detected
YMC1	YPR058W	CCE1	Q03702	353 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	HSP31	Q04432	237 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	CIA1	Q05583	330 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	GGA1	Q06336	557 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	ASA1	Q06822	443 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.08	□□□□□ -1.44	not detected
YMC1	YPR058W	IRC10	Q08118	586 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	RSB1	Q08417	382 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	MUM3	Q08750	479 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	UPC2	Q12151	913 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	TAF3	Q12297	353 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	TPK2	P06245	380 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	CCA1	P21269	546 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	SIR1	P21691	654 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	PXA2	P34230	853 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	CAF4	P36130	643 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
YMC1	YPR058W	IST2	P38250	946 aa		6.07	□□□□□ -1.44

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