RNA–Protein interactions for RNA: YOR299W

BUD7, Transcript of Member of the ChAPs family (Chs5p-Arf1p-binding proteins), yeast

Gene BUD7, Length 2,241 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD7	YOR299W	NSE1	Q07913	336 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	ACM1	Q08981	209 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	CBF1	P17106	351 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	SGF29	P25554	259 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	PPZ1	P26570	692 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	NDI1	P32340	513 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	AIM26	P32858	118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	SMF2	P38778	549 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	AXL2	P38928	823 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	DUN1	P39009	513 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	YEL068C	P39977	110 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	UBP7	P40453	1071 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	TAH11	P47112	604 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	SFB2	P53953	876 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	GRX3	Q03835	250 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	STE23	Q06010	1027 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	LDB18	Q07887	179 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	OCA6	Q12454	224 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	FAB1	P34756	2278 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	DAL81	P21657	970 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	MRPL8	P22353	238 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	MRPL25	P23369	157 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	RSC6	P25632	483 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	NGG1	P32494	702 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	LTV1	P34078	463 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	SET3	P36124	751 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	PXA1	P41909	870 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	RMD8	P43620	662 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	BNA2	P47125	453 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	NUP84	P52891	726 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	CDC14	Q00684	551 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	VHS3	Q08438	674 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	UBR1	P19812	1950 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	SEM1	O94742	89 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	COX5A	P00424	153 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	SLC1	P33333	303 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	YKL097C	P34245	136 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	YKL100C	P34248	587 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	TAT1	P38085	619 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	AXL1	P40851	1208 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	ZIP2	P53061	704 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	GND2	P53319	492 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	ORC3	P54790	616 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	VID22	Q05934	901 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	ADY3	Q07732	790 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	IRC10	Q08118	586 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	TRM8	Q12009	286 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	GPA2	P10823	449 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	EMC1	P25574	760 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	YCL049C	P25577	312 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	URA10	P30402	227 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	OSW5	P40219	148 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	YFL054C	P43549	646 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	NIT3	P49954	291 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	PRM1	P53835	661 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	YNL058C	P53947	316 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	EFM6	P53970	246 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	PEX11	Q12462	236 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD7	YOR299W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BUD7	YOR299W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BUD7	YOR299W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BUD7	YOR299W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
BUD7	YOR299W	PHO3	P24031	467 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BUD7	YOR299W	NFS1	P25374	497 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BUD7	YOR299W	GEX1	P25596	615 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BUD7	YOR299W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BUD7	YOR299W	CDC20	P26309	610 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BUD7	YOR299W	LIP5	P32875	414 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BUD7	YOR299W	GEX2	P36173	615 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BUD7	YOR299W	REV7	P38927	245 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BUD7	YOR299W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BUD7	YOR299W	SIP4	P46954	829 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BUD7	YOR299W	AIM23	P47015	356 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BUD7	YOR299W	MAD3	P47074	515 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BUD7	YOR299W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65

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