RNA–Protein interactions for RNA: YOR156C

NFI1, Transcript of SUMO E3 ligase, yeast

Gene NFI1, Length 2,181 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NFI1	YOR156C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	CDC45	Q08032	650 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	VRG4	P40107	337 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	STP1	Q00947	519 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	TOF2	Q02208	771 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.01	□□□□□ -1.61	not detected
NFI1	YOR156C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	RPC53	P25441	422 aa		5	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	YME1	P32795	747 aa		5	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	SAS3	P34218	831 aa		5	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	SCO2	P38072	301 aa		5	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	SOL4	P53315	255 aa		5	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	IZH1	Q03419	316 aa		5	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	EKI1	Q03764	534 aa		5	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	YDL057W	Q07379	328 aa		5	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		5	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	PTP1	P25044	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	AIM22	P47051	409 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	YGR126W	P53274	230 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	TAP42	Q04372	366 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	ROT2	P38138	954 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	ESBP6	P53918	673 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	RDR1	Q08904	546 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	YHR210C	P38893	341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	HXT14	P42833	540 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	ECI1	Q05871	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	PDX1	P16451	410 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	PDR3	P33200	976 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	PCL6	P40038	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	SNG1	P46950	547 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	ISN1	Q99312	450 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	GID7	P25569	745 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	MGM1	P32266	881 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	YPK3	P38070	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	YNL234W	P53857	426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	YMR160W	Q03823	816 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	CLB3	P24870	427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	BUD32	P53323	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	YNL181W	P53878	407 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFI1	YOR156C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	PEP5	P12868	1029 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	BUD14	P27637	709 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	SNC1	P31109	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	LAG1	P38703	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	RTS2	P40962	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	FET5	P43561	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YJR154W	P47181	346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	DUG3	P53871	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	SLG1	P54867	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	RHO4	Q00246	291 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	MBB1	P39534	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	PCI8	P40512	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	IAH1	P41734	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	MDV1	P47025	714 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	SHR3	Q02774	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	SHP1	P34223	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	ASK1	P35734	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	SSK1	Q07084	712 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	THP1	Q08231	455 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	ADK2	P26364	225 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	SPC34	P36131	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	ATG27	P46989	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	GEP3	Q08622	556 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	UBX3	Q12229	455 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	COR1	P07256	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	SNT1	P25357	1226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	PHD1	P36093	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	EFM2	P38347	419 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFI1	YOR156C	ERG7	P38604	731 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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