RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A DEG1P31115 442 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A MRP20P32387 263 aa2.47□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A SRO77P38163 1010 aa2.47□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A UME6P39001 836 aa2.47□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A FMP10P40098 244 aa2.47□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A ALG8P40351 577 aa2.47□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A PAP2P53632 584 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A PSR1Q07800 427 aa2.47□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A ENT4Q07872 247 aa2.47□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A CTF3Q12748 733 aa2.47□□□□□ -2.01
YMR001C-AYMR001C-A SNF1P06782 633 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A RNA14P25298 677 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A LSB5P25369 354 aa2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A PUT3P25502 979 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A SYN8P31377 255 aa2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A DBF20P32328 564 aa2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A PDB1P32473 366 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A MSN2P33748 704 aa2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A HAT2P39984 401 aa2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A SNG1P46950 547 aa2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A SHR3Q02774 210 aa2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A DPB4Q04603 196 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A HEL2Q05580 639 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A BNA5Q05979 453 aa2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A SDH5Q08230 162 aa2.46□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A SOD1P00445 154 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A PEP5P12868 1029 aa2.45□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A CPR1P14832 162 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A KGD1P20967 1014 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A YME1P32795 747 aa2.45□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A SWD3P38123 315 aa2.45□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A YNG2P38806 282 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A NDT80P38830 627 aa2.45□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A SDT1P53078 280 aa2.45□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A SLD5Q03406 294 aa2.45□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A RCO1Q04779 684 aa2.45□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A MHR1Q06630 226 aa2.45□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A TMS1Q12116 473 aa2.45□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A SPT15P13393 240 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A CBF2P32504 956 aa2.44□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A XRS2P33301 854 aa2.44□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A YKL100CP34248 587 aa2.44□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A YIL067CP40514 678 aa2.44□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A LYS4P49367 693 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A DSD1P53095 428 aa2.44□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A DRN1P53255 507 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A VID22Q05934 901 aa2.44□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A CLN3P13365 580 aa2.43□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A VMA16P23968 213 aa2.43□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A BUD5P25300 642 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A SGF29P25554 259 aa2.43□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A YBL059WP34224 193 aa2.43□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A PTR3P43606 678 aa2.43□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A ALT2P52892 507 aa2.43□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A UBX4P54730 416 aa2.43□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A ELP3Q02908 557 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A MSC1Q03104 513 aa2.43□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data2.43□□□□□ -2.02not detected
YMR001C-AYMR001C-A ADH7P25377 361 aa2.42□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A YKL023WP36103 277 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A BTN2P53286 410 aa2.42□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A YLR152CP54072 576 aa2.42□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A IRC15Q02733 499 aa2.42□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A SNO4Q04902 237 aa2.42□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A YDL057WQ07379 328 aa2.42□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A HSP33Q08914 237 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A HSP32Q08992 237 aa2.42□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A HRT3Q12347 344 aa2.42□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A ISY1P21374 235 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A MRP4P32902 394 aa2.41□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data2.41□□□□□ -2.02not detected
YMR001C-AYMR001C-A YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A RPL32P38061 130 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A YGR210CP42942 411 aa2.41□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A YGL039WP53183 348 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A IVY1Q04934 453 aa2.41□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A PBA1Q05778 276 aa2.41□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A MRPL35Q06678 367 aa2.41□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A RIX7Q07844 837 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A ERV2Q12284 196 aa2.41□□□□□ -2.02
YMR001C-AYMR001C-A RAD52P06778 471 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A CHS1P08004 1131 aa2.4□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A PUP3P25451 205 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A SPR1P32603 445 aa2.4□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A NUP133P36161 1157 aa2.4□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A ICS2P38284 255 aa2.4□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A YJR154WP47181 346 aa2.4□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A AAD10P47182 288 aa2.4□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A VPS74Q06385 345 aa2.4□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A YOL087CQ99247 1116 aa2.4□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A ADH2P00331 348 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A LPD1P09624 499 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A NAT1P12945 854 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A BOS1P25385 244 aa2.39□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A IMG1P25626 169 aa2.39□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A AXL2P38928 823 aa2.39□□□□□ -2.03
YMR001C-AYMR001C-A YER010CP40011 234 aa2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 265.4 ms