RNA–Protein interactions for RNA: YLR363C

NMD4, Transcript of Protein that may be involved in nonsense-mediated mRNA decay, yeast

Gene NMD4, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD4	YLR363C	SWP82	P43554	623 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NMD4	YLR363C	CTK2	P46962	323 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NMD4	YLR363C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
NMD4	YLR363C	ASI1	P54074	624 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NMD4	YLR363C	SLD5	Q03406	294 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NMD4	YLR363C	IZH1	Q03419	316 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NMD4	YLR363C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
NMD4	YLR363C	ERP3	Q12403	225 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NMD4	YLR363C	RTP1	Q12751	981 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NMD4	YLR363C	RAD50	P12753	1312 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	CHO1	P08456	276 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	YFL068W	P0CX99	160 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	CLC1	P17891	233 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	CDC15	P27636	974 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	SHP1	P34223	423 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	MNN2	P38069	597 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	LIF1	P53150	421 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	RSM28	Q03430	361 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	NKP2	Q06162	153 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	PSR2	Q07949	397 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	MAK31	P23059	88 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	MET30	P39014	640 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	ECM10	P39987	644 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	YMR321C	Q04898	105 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	ARP9	Q05123	467 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	YLR281C	Q05863	155 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	RIM20	Q12033	661 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	RAP1	P11938	827 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	PSY4	P38193	441 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	REG2	P38232	338 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	VRG4	P40107	337 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	YIL169C	P40442	995 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	FMS1	P50264	508 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	ATG16	Q03818	150 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	MCP2	Q06567	569 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	VCX1	Q99385	411 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
NMD4	YLR363C	IES5	P40060	125 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	RIC1	P40395	1056 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	REG1	Q00816	1014 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	MDM1	Q01846	1127 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	ARP10	Q04549	284 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	HIP1	P06775	603 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	ERG8	P24521	451 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	CNS1	P33313	385 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	GCS1	P35197	352 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	YNL181W	P53878	407 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	BET4	Q00618	327 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	GRS2	Q06817	618 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	NUS1	Q12063	375 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	YLR302C	O13544	120 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	MAS2	P11914	482 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	PEP3	P27801	918 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	IMP2'	P32351	346 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	RKM3	P38222	552 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	LEU5	P38702	357 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	CSM2	P40465	213 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	AZR1	P50080	613 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	ESBP6	P53918	673 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	VPS72	Q03388	795 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	SUE1	Q06524	206 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	TRM8	Q12009	286 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NMD4	YLR363C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	CLB2	P24869	491 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	IME2	P32581	645 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YAT2	P40017	923 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YFR020W	P43600	232 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	IML2	P47031	731 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	BNA1	P47096	177 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	SGM1	P47166	707 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YNL234W	P53857	426 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	GTR1	Q00582	310 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YMR254C	Q04838	102 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	VID22	Q05934	901 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61

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