RNA–Protein interactions for RNA: YLR297W

YLR297W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YLR297W, Length 390 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR297W	YLR297W	TOP1	P04786	769 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	CKA2	P19454	339 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	ATO2	P32907	282 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	AXL1	P40851	1208 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	SAP185	P40856	1058 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	ASK10	P48361	1146 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	RTC4	P53850	401 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	YNL144C	P53907	740 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	ERO1	Q03103	563 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	UBX2	Q04228	584 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	YDR222W	Q04925	415 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	TRI1	Q05024	226 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	BUD7	Q08754	746 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	ARP6	Q12509	438 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	SMC6	Q12749	1114 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR297W	YLR297W	COX1	P00401	534 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	PEP5	P12868	1029 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	HEM15	P16622	393 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	PTC6	P25646	442 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	NIP100	P33420	868 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	SDS22	P36047	338 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	PFF1	P38244	976 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RRT2	P38332	387 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	MSG5	P38590	489 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	MMS21	P38632	267 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	STN1	P38960	494 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	MAF1	P41910	395 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	EAF6	P47128	113 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YGR021W	P53212	290 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YPR003C	P53394	754 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	TEP1	P53916	434 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	VPS72	Q03388	795 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YLR297W	Q05899	129 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	ATX2	Q12067	313 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YLR462W	O13556	202 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	MSS51	P32335	436 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	NFU1	P32860	256 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	UBP13	P38187	747 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	FZO1	P38297	855 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YHL049C	P38722	271 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YDR089W	P38966	869 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	END3	P39013	349 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YEL075C	P39972	122 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YER189W	P40104	122 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YFL064C	P43540	174 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	ASG7	P46993	209 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	FMS1	P50264	508 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	ORC5	P50874	479 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	VPS4	P52917	437 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	TAM41	P53230	385 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	UBX4	P54730	416 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	OSH6	Q02201	448 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	PPM1	Q04081	328 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	FAR8	Q05040	523 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YLH47	Q06493	454 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YPR078C	Q06813	372 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	AAD4	Q07747	329 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	SRL1	Q08673	210 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	NCA2	Q12374	616 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	GRX6	Q12438	231 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	POL3	P15436	1097 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	CDC42	P19073	191 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	CNA1	P23287	553 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	DAL2	P25335	343 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YCR043C	P25361	127 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	SAS3	P34218	831 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	SHP1	P34223	423 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
YLR297W	YLR297W	YBL028C	P38202	106 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	HIS2	P38635	335 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	VPS45	P38932	577 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YJL107C	P42947	387 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	SAD1	P43589	448 aa		3.13	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.7 ms